Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG2

Plxna4, Plexin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna4Q80UG2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Plxna4Q80UG2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Plxna4Q80UG2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Plxna4Q80UG2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Plxna4Q80UG2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Plxna4Q80UG2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Plxna4Q80UG2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Plxna4Q80UG2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Plxna4Q80UG2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Plxna4Q80UG2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Plxna4Q80UG2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Plxna4Q80UG2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Plxna4Q80UG2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Plxna4Q80UG2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Plxna4Q80UG2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Plxna4Q80UG2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Plxna4Q80UG2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Plxna4Q80UG2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Plxna4Q80UG2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Plxna4Q80UG2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Plxna4Q80UG2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Plxna4Q80UG2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Plxna4Q80UG2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Plxna4Q80UG2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Plxna4Q80UG2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Plxna4Q80UG2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Plxna4Q80UG2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Plxna4Q80UG2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Plxna4Q80UG2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Plxna4Q80UG2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Plxna4Q80UG2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Plxna4Q80UG2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Plxna4Q80UG2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Plxna4Q80UG2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Plxna4Q80UG2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Plxna4Q80UG2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Plxna4Q80UG2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Plxna4Q80UG2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Plxna4Q80UG2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Plxna4Q80UG2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Plxna4Q80UG2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Plxna4Q80UG2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Plxna4Q80UG2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Plxna4Q80UG2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Plxna4Q80UG2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Plxna4Q80UG2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Plxna4Q80UG2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Plxna4Q80UG2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Plxna4Q80UG2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Plxna4Q80UG2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Plxna4Q80UG2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Plxna4Q80UG2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Plxna4Q80UG2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Plxna4Q80UG2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Plxna4Q80UG2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Plxna4Q80UG2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Plxna4Q80UG2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Plxna4Q80UG2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Plxna4Q80UG2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Plxna4Q80UG2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Plxna4Q80UG2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Plxna4Q80UG2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Plxna4Q80UG2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Plxna4Q80UG2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Plxna4Q80UG2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Plxna4Q80UG2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Plxna4Q80UG2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Plxna4Q80UG2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Plxna4Q80UG2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Plxna4Q80UG2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Plxna4Q80UG2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Plxna4Q80UG2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Plxna4Q80UG2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Plxna4Q80UG2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Plxna4Q80UG2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Plxna4Q80UG2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Plxna4Q80UG2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Plxna4Q80UG2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Plxna4Q80UG2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Plxna4Q80UG2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Plxna4Q80UG2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Plxna4Q80UG2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Plxna4Q80UG2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Plxna4Q80UG2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Plxna4Q80UG2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Plxna4Q80UG2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Plxna4Q80UG2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Plxna4Q80UG2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Plxna4Q80UG2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Plxna4Q80UG2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Plxna4Q80UG2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Plxna4Q80UG2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Plxna4Q80UG2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Plxna4Q80UG2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Plxna4Q80UG2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Plxna4Q80UG2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Plxna4Q80UG2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Plxna4Q80UG2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Plxna4Q80UG2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Plxna4Q80UG2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms