Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup214Q80U93 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup214Q80U93 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup214Q80U93 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup214Q80U93 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup214Q80U93 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup214Q80U93 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup214Q80U93 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup214Q80U93 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup214Q80U93 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup214Q80U93 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup214Q80U93 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup214Q80U93 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup214Q80U93 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup214Q80U93 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup214Q80U93 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup214Q80U93 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup214Q80U93 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup214Q80U93 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup214Q80U93 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup214Q80U93 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup214Q80U93 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup214Q80U93 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup214Q80U93 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup214Q80U93 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup214Q80U93 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup214Q80U93 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup214Q80U93 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup214Q80U93 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup214Q80U93 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup214Q80U93 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup214Q80U93 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup214Q80U93 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup214Q80U93 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup214Q80U93 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup214Q80U93 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup214Q80U93 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup214Q80U93 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup214Q80U93 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup214Q80U93 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup214Q80U93 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup214Q80U93 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup214Q80U93 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup214Q80U93 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup214Q80U93 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup214Q80U93 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup214Q80U93 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup214Q80U93 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup214Q80U93 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup214Q80U93 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup214Q80U93 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup214Q80U93 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup214Q80U93 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup214Q80U93 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup214Q80U93 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup214Q80U93 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup214Q80U93 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup214Q80U93 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup214Q80U93 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup214Q80U93 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup214Q80U93 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup214Q80U93 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup214Q80U93 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup214Q80U93 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup214Q80U93 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup214Q80U93 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup214Q80U93 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup214Q80U93 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup214Q80U93 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup214Q80U93 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup214Q80U93 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup214Q80U93 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup214Q80U93 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup214Q80U93 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup214Q80U93 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup214Q80U93 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup214Q80U93 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup214Q80U93 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup214Q80U93 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup214Q80U93 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup214Q80U93 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup214Q80U93 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup214Q80U93 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup214Q80U93 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup214Q80U93 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup214Q80U93 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup214Q80U93 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup214Q80U93 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup214Q80U93 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup214Q80U93 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup214Q80U93 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup214Q80U93 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup214Q80U93 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup214Q80U93 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup214Q80U93 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup214Q80U93 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nup214Q80U93 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup214Q80U93 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup214Q80U93 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup214Q80U93 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms