Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.99■■■■■ 6.55
NischQ80TM9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC55.99■■■■■ 6.55
NischQ80TM9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.95■■■■■ 6.55
NischQ80TM9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC55.91■■■■■ 6.54
NischQ80TM9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC55.91■■■■■ 6.54
NischQ80TM9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.89■■■■■ 6.54
NischQ80TM9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC55.88■■■■■ 6.54
NischQ80TM9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.88■■■■■ 6.54
NischQ80TM9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.76■■■■■ 6.52
NischQ80TM9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC55.74■■■■■ 6.51
NischQ80TM9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC55.74■■■■■ 6.51
NischQ80TM9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC55.74■■■■■ 6.51
NischQ80TM9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC55.72■■■■■ 6.51
NischQ80TM9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC55.71■■■■■ 6.51
NischQ80TM9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.71■■■■■ 6.51
NischQ80TM9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC55.69■■■■■ 6.51
NischQ80TM9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC55.69■■■■■ 6.51
NischQ80TM9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.68■■■■■ 6.5
NischQ80TM9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC55.65■■■■■ 6.5
NischQ80TM9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC55.64■■■■■ 6.5
NischQ80TM9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.62■■■■■ 6.49
NischQ80TM9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC55.62■■■■■ 6.49
NischQ80TM9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC55.62■■■■■ 6.49
NischQ80TM9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.61■■■■■ 6.49
NischQ80TM9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC55.57■■■■■ 6.49
NischQ80TM9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.55■■■■■ 6.48
NischQ80TM9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.54■■■■■ 6.48
NischQ80TM9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.53■■■■■ 6.48
NischQ80TM9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC55.51■■■■■ 6.48
NischQ80TM9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.49■■■■■ 6.47
NischQ80TM9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC55.47■■■■■ 6.47
NischQ80TM9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC55.45■■■■■ 6.47
NischQ80TM9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.42■■■■■ 6.46
NischQ80TM9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC55.42■■■■■ 6.46
NischQ80TM9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.42■■■■■ 6.46
NischQ80TM9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC55.42■■■■■ 6.46
NischQ80TM9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC55.41■■■■■ 6.46
NischQ80TM9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC55.38■■■■■ 6.46
NischQ80TM9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.37■■■■■ 6.45
NischQ80TM9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.36■■■■■ 6.45
NischQ80TM9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.35■■■■■ 6.45
NischQ80TM9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC55.34■■■■■ 6.45
NischQ80TM9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC55.33■■■■■ 6.45
NischQ80TM9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.3■■■■■ 6.44
NischQ80TM9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.28■■■■■ 6.44
NischQ80TM9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC55.27■■■■■ 6.44
NischQ80TM9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC55.23■■■■■ 6.43
NischQ80TM9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.23■■■■■ 6.43
NischQ80TM9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.23■■■■■ 6.43
NischQ80TM9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC55.23■■■■■ 6.43
NischQ80TM9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.21■■■■■ 6.43
NischQ80TM9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC55.21■■■■■ 6.43
NischQ80TM9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC55.19■■■■■ 6.43
NischQ80TM9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.19■■■■■ 6.43
NischQ80TM9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC55.15■■■■■ 6.42
NischQ80TM9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.14■■■■■ 6.42
NischQ80TM9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC55.12■■■■■ 6.41
NischQ80TM9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC55.1■■■■■ 6.41
NischQ80TM9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.08■■■■■ 6.41
NischQ80TM9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.06■■■■■ 6.4
NischQ80TM9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC55.03■■■■■ 6.4
NischQ80TM9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC55.02■■■■■ 6.4
NischQ80TM9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55■■■■■ 6.39
NischQ80TM9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.99■■■■■ 6.39
NischQ80TM9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.98■■■■■ 6.39
NischQ80TM9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC54.97■■■■■ 6.39
NischQ80TM9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC54.95■■■■■ 6.39
NischQ80TM9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.95■■■■■ 6.39
NischQ80TM9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.93■■■■■ 6.38
NischQ80TM9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC54.92■■■■■ 6.38
NischQ80TM9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC54.9■■■■■ 6.38
NischQ80TM9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.84■■■■■ 6.37
NischQ80TM9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.81■■■■■ 6.36
NischQ80TM9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.81■■■■■ 6.36
NischQ80TM9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.8■■■■■ 6.36
NischQ80TM9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC54.8■■■■■ 6.36
NischQ80TM9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC54.76■■■■■ 6.36
NischQ80TM9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC54.75■■■■■ 6.36
NischQ80TM9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.75■■■■■ 6.36
NischQ80TM9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC54.73■■■■■ 6.35
NischQ80TM9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC54.72■■■■■ 6.35
NischQ80TM9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC54.72■■■■■ 6.35
NischQ80TM9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC54.71■■■■■ 6.35
NischQ80TM9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC54.67■■■■■ 6.34
NischQ80TM9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.66■■■■■ 6.34
NischQ80TM9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.66■■■■■ 6.34
NischQ80TM9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC54.63■■■■■ 6.34
NischQ80TM9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC54.63■■■■■ 6.34
NischQ80TM9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC54.61■■■■■ 6.33
NischQ80TM9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.61■■■■■ 6.33
NischQ80TM9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC54.6■■■■■ 6.33
NischQ80TM9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.6■■■■■ 6.33
NischQ80TM9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC54.59■■■■■ 6.33
NischQ80TM9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.58■■■■■ 6.33
NischQ80TM9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.58■■■■■ 6.33
NischQ80TM9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.56■■■■■ 6.32
NischQ80TM9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.55■■■■■ 6.32
NischQ80TM9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.55■■■■■ 6.32
NischQ80TM9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.54■■■■■ 6.32
NischQ80TM9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC54.54■■■■■ 6.32
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