Protein–RNA interactions for Protein: Q80TF4

Klhl13, Kelch-like protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl13Q80TF4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhl13Q80TF4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klhl13Q80TF4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klhl13Q80TF4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klhl13Q80TF4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klhl13Q80TF4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klhl13Q80TF4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klhl13Q80TF4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhl13Q80TF4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhl13Q80TF4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhl13Q80TF4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhl13Q80TF4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhl13Q80TF4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhl13Q80TF4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhl13Q80TF4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klhl13Q80TF4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Klhl13Q80TF4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Klhl13Q80TF4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Klhl13Q80TF4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl13Q80TF4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl13Q80TF4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhl13Q80TF4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl13Q80TF4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhl13Q80TF4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhl13Q80TF4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl13Q80TF4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl13Q80TF4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhl13Q80TF4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhl13Q80TF4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhl13Q80TF4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhl13Q80TF4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klhl13Q80TF4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhl13Q80TF4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhl13Q80TF4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhl13Q80TF4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhl13Q80TF4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl13Q80TF4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl13Q80TF4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl13Q80TF4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl13Q80TF4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl13Q80TF4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl13Q80TF4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl13Q80TF4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl13Q80TF4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl13Q80TF4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl13Q80TF4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhl13Q80TF4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhl13Q80TF4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhl13Q80TF4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Klhl13Q80TF4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhl13Q80TF4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhl13Q80TF4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhl13Q80TF4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhl13Q80TF4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhl13Q80TF4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl13Q80TF4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl13Q80TF4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl13Q80TF4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl13Q80TF4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl13Q80TF4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl13Q80TF4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl13Q80TF4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl13Q80TF4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl13Q80TF4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl13Q80TF4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klhl13Q80TF4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Klhl13Q80TF4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Klhl13Q80TF4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl13Q80TF4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl13Q80TF4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl13Q80TF4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl13Q80TF4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl13Q80TF4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl13Q80TF4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl13Q80TF4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl13Q80TF4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl13Q80TF4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl13Q80TF4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl13Q80TF4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl13Q80TF4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl13Q80TF4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl13Q80TF4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl13Q80TF4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl13Q80TF4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl13Q80TF4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl13Q80TF4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl13Q80TF4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl13Q80TF4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl13Q80TF4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl13Q80TF4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl13Q80TF4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl13Q80TF4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl13Q80TF4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl13Q80TF4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl13Q80TF4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl13Q80TF4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl13Q80TF4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl13Q80TF4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl13Q80TF4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl13Q80TF4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms