Protein–RNA interactions for Protein: Q80TE0

Rpap1, RNA polymerase II-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap1Q80TE0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,14■■■■■ 4,18
Rpap1Q80TE0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,14■■■■■ 4,18
Rpap1Q80TE0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC41,13■■■■■ 4,18
Rpap1Q80TE0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC41,12■■■■■ 4,17
Rpap1Q80TE0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41,11■■■■■ 4,17
Rpap1Q80TE0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,11■■■■■ 4,17
Rpap1Q80TE0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,09■■■■■ 4,17
Rpap1Q80TE0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC41,09■■■■■ 4,17
Rpap1Q80TE0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,09■■■■■ 4,17
Rpap1Q80TE0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,06■■■■■ 4,16
Rpap1Q80TE0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC41,06■■■■■ 4,16
Rpap1Q80TE0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,03■■■■■ 4,16
Rpap1Q80TE0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC41,01■■■■■ 4,16
Rpap1Q80TE0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,99■■■■■ 4,15
Rpap1Q80TE0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC40,98■■■■■ 4,15
Rpap1Q80TE0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,97■■■■■ 4,15
Rpap1Q80TE0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC40,96■■■■■ 4,15
Rpap1Q80TE0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC40,95■■■■■ 4,15
Rpap1Q80TE0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,94■■■■■ 4,14
Rpap1Q80TE0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,94■■■■■ 4,14
Rpap1Q80TE0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,9■■■■■ 4,14
Rpap1Q80TE0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC40,88■■■■■ 4,14
Rpap1Q80TE0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC40,86■■■■■ 4,13
Rpap1Q80TE0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC40,86■■■■■ 4,13
Rpap1Q80TE0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC40,85■■■■■ 4,13
Rpap1Q80TE0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40,84■■■■■ 4,13
Rpap1Q80TE0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC40,84■■■■■ 4,13
Rpap1Q80TE0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,84■■■■■ 4,13
Rpap1Q80TE0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC40,84■■■■■ 4,13
Rpap1Q80TE0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40,84■■■■■ 4,13
Rpap1Q80TE0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC40,83■■■■■ 4,13
Rpap1Q80TE0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,81■■■■■ 4,12
Rpap1Q80TE0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,79■■■■■ 4,12
Rpap1Q80TE0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC40,79■■■■■ 4,12
Rpap1Q80TE0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,77■■■■■ 4,12
Rpap1Q80TE0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40,77■■■■■ 4,12
Rpap1Q80TE0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC40,77■■■■■ 4,12
Rpap1Q80TE0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC40,76■■■■■ 4,11
Rpap1Q80TE0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,74■■■■■ 4,11
Rpap1Q80TE0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,74■■■■■ 4,11
Rpap1Q80TE0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,73■■■■■ 4,11
Rpap1Q80TE0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,71■■■■■ 4,11
Rpap1Q80TE0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,68■■■■■ 4,1
Rpap1Q80TE0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,67■■■■■ 4,1
Rpap1Q80TE0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,64■■■■■ 4,1
Rpap1Q80TE0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,61■■■■■ 4,09
Rpap1Q80TE0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC40,6■■■■■ 4,09
Rpap1Q80TE0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,58■■■■■ 4,09
Rpap1Q80TE0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,58■■■■■ 4,09
Rpap1Q80TE0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,57■■■■■ 4,09
Rpap1Q80TE0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC40,57■■■■■ 4,08
Rpap1Q80TE0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,55■■■■■ 4,08
Rpap1Q80TE0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,55■■■■■ 4,08
Rpap1Q80TE0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC40,53■■■■■ 4,08
Rpap1Q80TE0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC40,53■■■■■ 4,08
Rpap1Q80TE0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,52■■■■■ 4,08
Rpap1Q80TE0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,5■■■■■ 4,07
Rpap1Q80TE0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,5■■■■■ 4,07
Rpap1Q80TE0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC40,5■■■■■ 4,07
Rpap1Q80TE0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,47■■■■■ 4,07
Rpap1Q80TE0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC40,46■■■■■ 4,07
Rpap1Q80TE0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,45■■■■■ 4,07
Rpap1Q80TE0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC40,44■■■■■ 4,06
Rpap1Q80TE0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,43■■■■■ 4,06
Rpap1Q80TE0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC40,42■■■■■ 4,06
Rpap1Q80TE0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
Rpap1Q80TE0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
Rpap1Q80TE0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,41■■■■■ 4,06
Rpap1Q80TE0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,39■■■■■ 4,06
Rpap1Q80TE0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC40,38■■■■■ 4,05
Rpap1Q80TE0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC40,35■■■■■ 4,05
Rpap1Q80TE0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC40,33■■■■■ 4,05
Rpap1Q80TE0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40,33■■■■■ 4,05
Rpap1Q80TE0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,33■■■■■ 4,05
Rpap1Q80TE0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC40,31■■■■■ 4,04
Rpap1Q80TE0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,29■■■■■ 4,04
Rpap1Q80TE0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,29■■■■■ 4,04
Rpap1Q80TE0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,28■■■■■ 4,04
Rpap1Q80TE0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,27■■■■■ 4,04
Rpap1Q80TE0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,26■■■■■ 4,04
Rpap1Q80TE0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC40,25■■■■■ 4,03
Rpap1Q80TE0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC40,25■■■■■ 4,03
Rpap1Q80TE0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC40,21■■■■■ 4,03
Rpap1Q80TE0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,2■■■■■ 4,03
Rpap1Q80TE0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC40,17■■■■■ 4,02
Rpap1Q80TE0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC40,17■■■■■ 4,02
Rpap1Q80TE0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,16■■■■■ 4,02
Rpap1Q80TE0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC40,15■■■■■ 4,02
Rpap1Q80TE0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC40,14■■■■■ 4,02
Rpap1Q80TE0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,14■■■■■ 4,02
Rpap1Q80TE0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,13■■■■■ 4,01
Rpap1Q80TE0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC40,12■■■■■ 4,01
Rpap1Q80TE0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC40,12■■■■■ 4,01
Rpap1Q80TE0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC40,11■■■■■ 4,01
Rpap1Q80TE0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC40,11■■■■■ 4,01
Rpap1Q80TE0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,11■■■■■ 4,01
Rpap1Q80TE0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,11■■■■■ 4,01
Rpap1Q80TE0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC40,11■■■■■ 4,01
Rpap1Q80TE0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,1■■■■■ 4,01
Rpap1Q80TE0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC40,1■■■■■ 4,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,6 ms