Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ctdp1Q7TSG2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ctdp1Q7TSG2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ctdp1Q7TSG2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ctdp1Q7TSG2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ctdp1Q7TSG2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ctdp1Q7TSG2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ctdp1Q7TSG2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ctdp1Q7TSG2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ctdp1Q7TSG2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ctdp1Q7TSG2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ctdp1Q7TSG2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ctdp1Q7TSG2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ctdp1Q7TSG2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ctdp1Q7TSG2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ctdp1Q7TSG2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ctdp1Q7TSG2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ctdp1Q7TSG2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ctdp1Q7TSG2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ctdp1Q7TSG2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ctdp1Q7TSG2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ctdp1Q7TSG2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ctdp1Q7TSG2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ctdp1Q7TSG2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ctdp1Q7TSG2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ctdp1Q7TSG2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ctdp1Q7TSG2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ctdp1Q7TSG2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ctdp1Q7TSG2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ctdp1Q7TSG2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ctdp1Q7TSG2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ctdp1Q7TSG2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ctdp1Q7TSG2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ctdp1Q7TSG2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ctdp1Q7TSG2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ctdp1Q7TSG2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ctdp1Q7TSG2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ctdp1Q7TSG2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ctdp1Q7TSG2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ctdp1Q7TSG2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ctdp1Q7TSG2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ctdp1Q7TSG2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ctdp1Q7TSG2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ctdp1Q7TSG2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ctdp1Q7TSG2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ctdp1Q7TSG2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ctdp1Q7TSG2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ctdp1Q7TSG2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ctdp1Q7TSG2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ctdp1Q7TSG2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ctdp1Q7TSG2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ctdp1Q7TSG2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ctdp1Q7TSG2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ctdp1Q7TSG2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ctdp1Q7TSG2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ctdp1Q7TSG2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ctdp1Q7TSG2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ctdp1Q7TSG2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ctdp1Q7TSG2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ctdp1Q7TSG2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ctdp1Q7TSG2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ctdp1Q7TSG2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ctdp1Q7TSG2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ctdp1Q7TSG2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ctdp1Q7TSG2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ctdp1Q7TSG2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ctdp1Q7TSG2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ctdp1Q7TSG2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ctdp1Q7TSG2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ctdp1Q7TSG2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ctdp1Q7TSG2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ctdp1Q7TSG2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ctdp1Q7TSG2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ctdp1Q7TSG2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ctdp1Q7TSG2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ctdp1Q7TSG2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ctdp1Q7TSG2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ctdp1Q7TSG2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ctdp1Q7TSG2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ctdp1Q7TSG2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ctdp1Q7TSG2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ctdp1Q7TSG2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ctdp1Q7TSG2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ctdp1Q7TSG2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ctdp1Q7TSG2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ctdp1Q7TSG2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ctdp1Q7TSG2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ctdp1Q7TSG2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ctdp1Q7TSG2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ctdp1Q7TSG2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ctdp1Q7TSG2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ctdp1Q7TSG2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ctdp1Q7TSG2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ctdp1Q7TSG2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ctdp1Q7TSG2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ctdp1Q7TSG2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ctdp1Q7TSG2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ctdp1Q7TSG2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms