Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ33

Rgmb, RGM domain family member B, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmbQ7TQ33 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RgmbQ7TQ33 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RgmbQ7TQ33 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RgmbQ7TQ33 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RgmbQ7TQ33 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
RgmbQ7TQ33 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RgmbQ7TQ33 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RgmbQ7TQ33 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RgmbQ7TQ33 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RgmbQ7TQ33 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RgmbQ7TQ33 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RgmbQ7TQ33 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
RgmbQ7TQ33 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RgmbQ7TQ33 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RgmbQ7TQ33 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RgmbQ7TQ33 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34■■■■□ 3.03
RgmbQ7TQ33 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
RgmbQ7TQ33 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RgmbQ7TQ33 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RgmbQ7TQ33 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RgmbQ7TQ33 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RgmbQ7TQ33 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RgmbQ7TQ33 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
RgmbQ7TQ33 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RgmbQ7TQ33 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RgmbQ7TQ33 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RgmbQ7TQ33 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RgmbQ7TQ33 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RgmbQ7TQ33 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RgmbQ7TQ33 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RgmbQ7TQ33 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RgmbQ7TQ33 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RgmbQ7TQ33 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RgmbQ7TQ33 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RgmbQ7TQ33 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RgmbQ7TQ33 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RgmbQ7TQ33 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RgmbQ7TQ33 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RgmbQ7TQ33 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RgmbQ7TQ33 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
RgmbQ7TQ33 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RgmbQ7TQ33 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
RgmbQ7TQ33 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
RgmbQ7TQ33 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RgmbQ7TQ33 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RgmbQ7TQ33 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RgmbQ7TQ33 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RgmbQ7TQ33 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RgmbQ7TQ33 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RgmbQ7TQ33 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RgmbQ7TQ33 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RgmbQ7TQ33 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RgmbQ7TQ33 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
RgmbQ7TQ33 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
RgmbQ7TQ33 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RgmbQ7TQ33 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RgmbQ7TQ33 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RgmbQ7TQ33 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RgmbQ7TQ33 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RgmbQ7TQ33 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RgmbQ7TQ33 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RgmbQ7TQ33 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RgmbQ7TQ33 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RgmbQ7TQ33 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RgmbQ7TQ33 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RgmbQ7TQ33 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RgmbQ7TQ33 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RgmbQ7TQ33 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
RgmbQ7TQ33 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RgmbQ7TQ33 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RgmbQ7TQ33 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RgmbQ7TQ33 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RgmbQ7TQ33 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RgmbQ7TQ33 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RgmbQ7TQ33 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RgmbQ7TQ33 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RgmbQ7TQ33 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RgmbQ7TQ33 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RgmbQ7TQ33 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RgmbQ7TQ33 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RgmbQ7TQ33 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RgmbQ7TQ33 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RgmbQ7TQ33 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RgmbQ7TQ33 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RgmbQ7TQ33 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RgmbQ7TQ33 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RgmbQ7TQ33 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RgmbQ7TQ33 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RgmbQ7TQ33 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33.39■■■□□ 2.93
RgmbQ7TQ33 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
RgmbQ7TQ33 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RgmbQ7TQ33 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RgmbQ7TQ33 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RgmbQ7TQ33 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RgmbQ7TQ33 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RgmbQ7TQ33 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RgmbQ7TQ33 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
RgmbQ7TQ33 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RgmbQ7TQ33 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RgmbQ7TQ33 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms