Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dsg4Q7TMD7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dsg4Q7TMD7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dsg4Q7TMD7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dsg4Q7TMD7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dsg4Q7TMD7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dsg4Q7TMD7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dsg4Q7TMD7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Dsg4Q7TMD7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dsg4Q7TMD7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dsg4Q7TMD7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dsg4Q7TMD7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dsg4Q7TMD7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dsg4Q7TMD7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dsg4Q7TMD7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dsg4Q7TMD7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dsg4Q7TMD7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Dsg4Q7TMD7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dsg4Q7TMD7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dsg4Q7TMD7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dsg4Q7TMD7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dsg4Q7TMD7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dsg4Q7TMD7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dsg4Q7TMD7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dsg4Q7TMD7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dsg4Q7TMD7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dsg4Q7TMD7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dsg4Q7TMD7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Dsg4Q7TMD7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dsg4Q7TMD7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dsg4Q7TMD7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dsg4Q7TMD7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dsg4Q7TMD7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Dsg4Q7TMD7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dsg4Q7TMD7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dsg4Q7TMD7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dsg4Q7TMD7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dsg4Q7TMD7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dsg4Q7TMD7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dsg4Q7TMD7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dsg4Q7TMD7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dsg4Q7TMD7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dsg4Q7TMD7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dsg4Q7TMD7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dsg4Q7TMD7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dsg4Q7TMD7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dsg4Q7TMD7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dsg4Q7TMD7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Dsg4Q7TMD7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dsg4Q7TMD7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dsg4Q7TMD7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dsg4Q7TMD7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dsg4Q7TMD7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Dsg4Q7TMD7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dsg4Q7TMD7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dsg4Q7TMD7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dsg4Q7TMD7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dsg4Q7TMD7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dsg4Q7TMD7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dsg4Q7TMD7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dsg4Q7TMD7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dsg4Q7TMD7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dsg4Q7TMD7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dsg4Q7TMD7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dsg4Q7TMD7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Dsg4Q7TMD7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dsg4Q7TMD7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dsg4Q7TMD7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dsg4Q7TMD7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dsg4Q7TMD7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dsg4Q7TMD7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dsg4Q7TMD7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dsg4Q7TMD7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dsg4Q7TMD7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dsg4Q7TMD7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dsg4Q7TMD7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dsg4Q7TMD7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dsg4Q7TMD7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dsg4Q7TMD7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dsg4Q7TMD7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dsg4Q7TMD7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dsg4Q7TMD7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dsg4Q7TMD7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dsg4Q7TMD7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dsg4Q7TMD7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dsg4Q7TMD7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dsg4Q7TMD7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dsg4Q7TMD7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dsg4Q7TMD7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dsg4Q7TMD7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dsg4Q7TMD7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dsg4Q7TMD7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dsg4Q7TMD7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dsg4Q7TMD7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dsg4Q7TMD7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dsg4Q7TMD7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dsg4Q7TMD7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dsg4Q7TMD7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dsg4Q7TMD7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dsg4Q7TMD7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms