Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Usp17leQ7M764 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Usp17leQ7M764 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Usp17leQ7M764 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp17leQ7M764 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp17leQ7M764 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp17leQ7M764 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp17leQ7M764 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp17leQ7M764 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Usp17leQ7M764 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Usp17leQ7M764 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp17leQ7M764 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp17leQ7M764 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp17leQ7M764 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp17leQ7M764 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp17leQ7M764 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp17leQ7M764 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Usp17leQ7M764 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp17leQ7M764 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp17leQ7M764 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp17leQ7M764 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp17leQ7M764 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp17leQ7M764 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp17leQ7M764 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp17leQ7M764 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp17leQ7M764 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Usp17leQ7M764 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp17leQ7M764 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp17leQ7M764 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp17leQ7M764 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp17leQ7M764 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp17leQ7M764 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp17leQ7M764 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Usp17leQ7M764 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Usp17leQ7M764 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Usp17leQ7M764 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Usp17leQ7M764 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp17leQ7M764 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp17leQ7M764 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp17leQ7M764 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp17leQ7M764 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp17leQ7M764 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp17leQ7M764 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Usp17leQ7M764 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Usp17leQ7M764 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp17leQ7M764 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp17leQ7M764 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp17leQ7M764 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Usp17leQ7M764 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp17leQ7M764 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Usp17leQ7M764 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp17leQ7M764 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp17leQ7M764 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp17leQ7M764 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp17leQ7M764 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp17leQ7M764 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp17leQ7M764 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp17leQ7M764 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp17leQ7M764 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp17leQ7M764 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp17leQ7M764 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp17leQ7M764 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp17leQ7M764 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp17leQ7M764 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp17leQ7M764 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp17leQ7M764 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp17leQ7M764 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp17leQ7M764 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp17leQ7M764 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp17leQ7M764 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp17leQ7M764 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Usp17leQ7M764 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Usp17leQ7M764 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp17leQ7M764 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp17leQ7M764 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp17leQ7M764 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp17leQ7M764 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp17leQ7M764 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp17leQ7M764 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp17leQ7M764 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp17leQ7M764 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp17leQ7M764 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp17leQ7M764 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp17leQ7M764 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp17leQ7M764 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp17leQ7M764 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp17leQ7M764 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp17leQ7M764 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp17leQ7M764 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Usp17leQ7M764 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp17leQ7M764 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp17leQ7M764 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Usp17leQ7M764 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Usp17leQ7M764 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp17leQ7M764 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp17leQ7M764 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp17leQ7M764 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp17leQ7M764 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp17leQ7M764 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp17leQ7M764 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms