Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pdcl2Q78Y63 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdcl2Q78Y63 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdcl2Q78Y63 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdcl2Q78Y63 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdcl2Q78Y63 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdcl2Q78Y63 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pdcl2Q78Y63 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pdcl2Q78Y63 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pdcl2Q78Y63 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pdcl2Q78Y63 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pdcl2Q78Y63 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pdcl2Q78Y63 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pdcl2Q78Y63 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pdcl2Q78Y63 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pdcl2Q78Y63 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pdcl2Q78Y63 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pdcl2Q78Y63 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pdcl2Q78Y63 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pdcl2Q78Y63 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pdcl2Q78Y63 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Pdcl2Q78Y63 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdcl2Q78Y63 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdcl2Q78Y63 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pdcl2Q78Y63 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pdcl2Q78Y63 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pdcl2Q78Y63 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdcl2Q78Y63 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdcl2Q78Y63 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdcl2Q78Y63 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdcl2Q78Y63 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pdcl2Q78Y63 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pdcl2Q78Y63 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pdcl2Q78Y63 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pdcl2Q78Y63 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pdcl2Q78Y63 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pdcl2Q78Y63 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pdcl2Q78Y63 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pdcl2Q78Y63 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pdcl2Q78Y63 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pdcl2Q78Y63 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pdcl2Q78Y63 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdcl2Q78Y63 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pdcl2Q78Y63 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdcl2Q78Y63 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdcl2Q78Y63 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pdcl2Q78Y63 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pdcl2Q78Y63 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pdcl2Q78Y63 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pdcl2Q78Y63 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pdcl2Q78Y63 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pdcl2Q78Y63 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pdcl2Q78Y63 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pdcl2Q78Y63 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pdcl2Q78Y63 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdcl2Q78Y63 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdcl2Q78Y63 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdcl2Q78Y63 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pdcl2Q78Y63 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pdcl2Q78Y63 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pdcl2Q78Y63 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdcl2Q78Y63 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdcl2Q78Y63 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pdcl2Q78Y63 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdcl2Q78Y63 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdcl2Q78Y63 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdcl2Q78Y63 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pdcl2Q78Y63 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pdcl2Q78Y63 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pdcl2Q78Y63 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pdcl2Q78Y63 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdcl2Q78Y63 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pdcl2Q78Y63 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pdcl2Q78Y63 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pdcl2Q78Y63 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pdcl2Q78Y63 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pdcl2Q78Y63 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdcl2Q78Y63 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdcl2Q78Y63 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdcl2Q78Y63 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdcl2Q78Y63 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pdcl2Q78Y63 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pdcl2Q78Y63 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pdcl2Q78Y63 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pdcl2Q78Y63 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pdcl2Q78Y63 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdcl2Q78Y63 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdcl2Q78Y63 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdcl2Q78Y63 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Pdcl2Q78Y63 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pdcl2Q78Y63 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pdcl2Q78Y63 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pdcl2Q78Y63 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pdcl2Q78Y63 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Pdcl2Q78Y63 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pdcl2Q78Y63 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pdcl2Q78Y63 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pdcl2Q78Y63 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pdcl2Q78Y63 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Pdcl2Q78Y63 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms