Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC38,02■■■■□ 3,68
Topbp1Q6ZQF0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,01■■■■□ 3,68
Topbp1Q6ZQF0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,01■■■■□ 3,68
Topbp1Q6ZQF0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3,67
Topbp1Q6ZQF0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC37,98■■■■□ 3,67
Topbp1Q6ZQF0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC37,92■■■■□ 3,66
Topbp1Q6ZQF0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,89■■■■□ 3,66
Topbp1Q6ZQF0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC37,89■■■■□ 3,66
Topbp1Q6ZQF0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37,89■■■■□ 3,66
Topbp1Q6ZQF0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,88■■■■□ 3,65
Topbp1Q6ZQF0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC37,87■■■■□ 3,65
Topbp1Q6ZQF0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,85■■■■□ 3,65
Topbp1Q6ZQF0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC37,84■■■■□ 3,65
Topbp1Q6ZQF0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,84■■■■□ 3,65
Topbp1Q6ZQF0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC37,83■■■■□ 3,65
Topbp1Q6ZQF0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC37,83■■■■□ 3,65
Topbp1Q6ZQF0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC37,81■■■■□ 3,64
Topbp1Q6ZQF0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,8■■■■□ 3,64
Topbp1Q6ZQF0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,79■■■■□ 3,64
Topbp1Q6ZQF0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,78■■■■□ 3,64
Topbp1Q6ZQF0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,78■■■■□ 3,64
Topbp1Q6ZQF0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC37,76■■■■□ 3,63
Topbp1Q6ZQF0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,75■■■■□ 3,63
Topbp1Q6ZQF0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC37,75■■■■□ 3,63
Topbp1Q6ZQF0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC37,74■■■■□ 3,63
Topbp1Q6ZQF0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37,74■■■■□ 3,63
Topbp1Q6ZQF0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,74■■■■□ 3,63
Topbp1Q6ZQF0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
Topbp1Q6ZQF0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,71■■■■□ 3,63
Topbp1Q6ZQF0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC37,71■■■■□ 3,63
Topbp1Q6ZQF0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC37,71■■■■□ 3,63
Topbp1Q6ZQF0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,7■■■■□ 3,63
Topbp1Q6ZQF0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC37,7■■■■□ 3,63
Topbp1Q6ZQF0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC37,7■■■■□ 3,63
Topbp1Q6ZQF0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,68■■■■□ 3,62
Topbp1Q6ZQF0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC37,67■■■■□ 3,62
Topbp1Q6ZQF0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,66■■■■□ 3,62
Topbp1Q6ZQF0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,66■■■■□ 3,62
Topbp1Q6ZQF0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC37,65■■■■□ 3,62
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37,64■■■■□ 3,62
Topbp1Q6ZQF0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC37,62■■■■□ 3,61
Topbp1Q6ZQF0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC37,61■■■■□ 3,61
Topbp1Q6ZQF0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,6■■■■□ 3,61
Topbp1Q6ZQF0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC37,57■■■■□ 3,6
Topbp1Q6ZQF0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC37,56■■■■□ 3,6
Topbp1Q6ZQF0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,53■■■■□ 3,6
Topbp1Q6ZQF0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC37,53■■■■□ 3,6
Topbp1Q6ZQF0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
Topbp1Q6ZQF0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
Topbp1Q6ZQF0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,49■■■■□ 3,59
Topbp1Q6ZQF0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC37,49■■■■□ 3,59
Topbp1Q6ZQF0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC37,47■■■■□ 3,59
Topbp1Q6ZQF0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Topbp1Q6ZQF0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC37,46■■■■□ 3,59
Topbp1Q6ZQF0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
Topbp1Q6ZQF0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,45■■■■□ 3,59
Topbp1Q6ZQF0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
Topbp1Q6ZQF0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
Topbp1Q6ZQF0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,44■■■■□ 3,58
Topbp1Q6ZQF0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC37,43■■■■□ 3,58
Topbp1Q6ZQF0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,43■■■■□ 3,58
Topbp1Q6ZQF0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,41■■■■□ 3,58
Topbp1Q6ZQF0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,39■■■■□ 3,58
Topbp1Q6ZQF0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC37,39■■■■□ 3,58
Topbp1Q6ZQF0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,37■■■■□ 3,57
Topbp1Q6ZQF0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37,37■■■■□ 3,57
Topbp1Q6ZQF0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC37,36■■■■□ 3,57
Topbp1Q6ZQF0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,35■■■■□ 3,57
Topbp1Q6ZQF0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC37,33■■■■□ 3,57
Topbp1Q6ZQF0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,31■■■■□ 3,56
Topbp1Q6ZQF0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,3■■■■□ 3,56
Topbp1Q6ZQF0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC37,27■■■■□ 3,56
Topbp1Q6ZQF0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,26■■■■□ 3,56
Topbp1Q6ZQF0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,23■■■■□ 3,55
Topbp1Q6ZQF0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,2■■■■□ 3,55
Topbp1Q6ZQF0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,2■■■■□ 3,55
Topbp1Q6ZQF0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,18■■■■□ 3,54
Topbp1Q6ZQF0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC37,17■■■■□ 3,54
Topbp1Q6ZQF0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,16■■■■□ 3,54
Topbp1Q6ZQF0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC37,15■■■■□ 3,54
Topbp1Q6ZQF0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC37,14■■■■□ 3,54
Topbp1Q6ZQF0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC37,14■■■■□ 3,54
Topbp1Q6ZQF0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,13■■■■□ 3,53
Topbp1Q6ZQF0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC37,13■■■■□ 3,53
Topbp1Q6ZQF0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37,13■■■■□ 3,53
Topbp1Q6ZQF0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,12■■■■□ 3,53
Topbp1Q6ZQF0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,11■■■■□ 3,53
Topbp1Q6ZQF0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Topbp1Q6ZQF0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,09■■■■□ 3,53
Topbp1Q6ZQF0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,09■■■■□ 3,53
Topbp1Q6ZQF0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC37,09■■■■□ 3,53
Topbp1Q6ZQF0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC37,08■■■■□ 3,53
Topbp1Q6ZQF0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC37,08■■■■□ 3,53
Topbp1Q6ZQF0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,08■■■■□ 3,53
Topbp1Q6ZQF0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,08■■■■□ 3,53
Topbp1Q6ZQF0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC37,07■■■■□ 3,53
Topbp1Q6ZQF0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC37,06■■■■□ 3,52
Topbp1Q6ZQF0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,05■■■■□ 3,52
Topbp1Q6ZQF0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC37,05■■■■□ 3,52
Topbp1Q6ZQF0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC37,04■■■■□ 3,52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms