Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY53

AY358078, HN1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY358078Q6UY53 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AY358078Q6UY53 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AY358078Q6UY53 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AY358078Q6UY53 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AY358078Q6UY53 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AY358078Q6UY53 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AY358078Q6UY53 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AY358078Q6UY53 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
AY358078Q6UY53 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AY358078Q6UY53 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AY358078Q6UY53 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AY358078Q6UY53 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AY358078Q6UY53 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AY358078Q6UY53 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AY358078Q6UY53 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AY358078Q6UY53 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AY358078Q6UY53 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AY358078Q6UY53 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AY358078Q6UY53 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AY358078Q6UY53 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AY358078Q6UY53 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AY358078Q6UY53 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AY358078Q6UY53 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AY358078Q6UY53 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AY358078Q6UY53 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AY358078Q6UY53 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AY358078Q6UY53 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AY358078Q6UY53 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AY358078Q6UY53 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AY358078Q6UY53 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AY358078Q6UY53 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AY358078Q6UY53 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AY358078Q6UY53 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AY358078Q6UY53 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AY358078Q6UY53 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
AY358078Q6UY53 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AY358078Q6UY53 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AY358078Q6UY53 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AY358078Q6UY53 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AY358078Q6UY53 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AY358078Q6UY53 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AY358078Q6UY53 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AY358078Q6UY53 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AY358078Q6UY53 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AY358078Q6UY53 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AY358078Q6UY53 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AY358078Q6UY53 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AY358078Q6UY53 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AY358078Q6UY53 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AY358078Q6UY53 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AY358078Q6UY53 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AY358078Q6UY53 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AY358078Q6UY53 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AY358078Q6UY53 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AY358078Q6UY53 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AY358078Q6UY53 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AY358078Q6UY53 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AY358078Q6UY53 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AY358078Q6UY53 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AY358078Q6UY53 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AY358078Q6UY53 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AY358078Q6UY53 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AY358078Q6UY53 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AY358078Q6UY53 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AY358078Q6UY53 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AY358078Q6UY53 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AY358078Q6UY53 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AY358078Q6UY53 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AY358078Q6UY53 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AY358078Q6UY53 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AY358078Q6UY53 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AY358078Q6UY53 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AY358078Q6UY53 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AY358078Q6UY53 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AY358078Q6UY53 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AY358078Q6UY53 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AY358078Q6UY53 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AY358078Q6UY53 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AY358078Q6UY53 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AY358078Q6UY53 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AY358078Q6UY53 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AY358078Q6UY53 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AY358078Q6UY53 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AY358078Q6UY53 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AY358078Q6UY53 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AY358078Q6UY53 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AY358078Q6UY53 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
AY358078Q6UY53 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AY358078Q6UY53 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AY358078Q6UY53 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AY358078Q6UY53 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AY358078Q6UY53 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AY358078Q6UY53 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AY358078Q6UY53 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AY358078Q6UY53 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
AY358078Q6UY53 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AY358078Q6UY53 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AY358078Q6UY53 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AY358078Q6UY53 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AY358078Q6UY53 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms