Protein–RNA interactions for Protein: Q6UGQ3

Scgb2b2, Secretoglobin family 2B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b2Q6UGQ3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scgb2b2Q6UGQ3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scgb2b2Q6UGQ3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Scgb2b2Q6UGQ3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scgb2b2Q6UGQ3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scgb2b2Q6UGQ3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scgb2b2Q6UGQ3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Scgb2b2Q6UGQ3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scgb2b2Q6UGQ3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scgb2b2Q6UGQ3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scgb2b2Q6UGQ3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Scgb2b2Q6UGQ3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scgb2b2Q6UGQ3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scgb2b2Q6UGQ3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scgb2b2Q6UGQ3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scgb2b2Q6UGQ3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Scgb2b2Q6UGQ3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scgb2b2Q6UGQ3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scgb2b2Q6UGQ3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scgb2b2Q6UGQ3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scgb2b2Q6UGQ3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scgb2b2Q6UGQ3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scgb2b2Q6UGQ3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scgb2b2Q6UGQ3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scgb2b2Q6UGQ3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scgb2b2Q6UGQ3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scgb2b2Q6UGQ3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scgb2b2Q6UGQ3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scgb2b2Q6UGQ3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scgb2b2Q6UGQ3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scgb2b2Q6UGQ3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scgb2b2Q6UGQ3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scgb2b2Q6UGQ3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scgb2b2Q6UGQ3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scgb2b2Q6UGQ3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scgb2b2Q6UGQ3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scgb2b2Q6UGQ3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scgb2b2Q6UGQ3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scgb2b2Q6UGQ3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scgb2b2Q6UGQ3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scgb2b2Q6UGQ3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scgb2b2Q6UGQ3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scgb2b2Q6UGQ3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scgb2b2Q6UGQ3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scgb2b2Q6UGQ3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scgb2b2Q6UGQ3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scgb2b2Q6UGQ3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scgb2b2Q6UGQ3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Scgb2b2Q6UGQ3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Scgb2b2Q6UGQ3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scgb2b2Q6UGQ3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scgb2b2Q6UGQ3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scgb2b2Q6UGQ3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scgb2b2Q6UGQ3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scgb2b2Q6UGQ3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scgb2b2Q6UGQ3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scgb2b2Q6UGQ3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scgb2b2Q6UGQ3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scgb2b2Q6UGQ3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scgb2b2Q6UGQ3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scgb2b2Q6UGQ3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.28■■□□□ 1
Scgb2b2Q6UGQ3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scgb2b2Q6UGQ3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scgb2b2Q6UGQ3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scgb2b2Q6UGQ3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scgb2b2Q6UGQ3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Scgb2b2Q6UGQ3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scgb2b2Q6UGQ3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scgb2b2Q6UGQ3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scgb2b2Q6UGQ3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scgb2b2Q6UGQ3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scgb2b2Q6UGQ3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scgb2b2Q6UGQ3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scgb2b2Q6UGQ3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scgb2b2Q6UGQ3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scgb2b2Q6UGQ3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scgb2b2Q6UGQ3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scgb2b2Q6UGQ3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scgb2b2Q6UGQ3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scgb2b2Q6UGQ3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scgb2b2Q6UGQ3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scgb2b2Q6UGQ3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms