Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Timd4Q6U7R4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Timd4Q6U7R4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Timd4Q6U7R4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Timd4Q6U7R4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Timd4Q6U7R4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Timd4Q6U7R4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Timd4Q6U7R4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Timd4Q6U7R4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Timd4Q6U7R4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Timd4Q6U7R4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Timd4Q6U7R4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Timd4Q6U7R4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Timd4Q6U7R4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Timd4Q6U7R4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Timd4Q6U7R4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Timd4Q6U7R4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Timd4Q6U7R4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Timd4Q6U7R4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Timd4Q6U7R4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Timd4Q6U7R4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Timd4Q6U7R4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Timd4Q6U7R4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Timd4Q6U7R4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Timd4Q6U7R4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Timd4Q6U7R4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Timd4Q6U7R4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Timd4Q6U7R4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Timd4Q6U7R4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Timd4Q6U7R4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Timd4Q6U7R4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Timd4Q6U7R4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Timd4Q6U7R4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Timd4Q6U7R4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Timd4Q6U7R4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Timd4Q6U7R4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Timd4Q6U7R4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Timd4Q6U7R4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Timd4Q6U7R4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Timd4Q6U7R4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Timd4Q6U7R4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Timd4Q6U7R4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Timd4Q6U7R4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Timd4Q6U7R4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Timd4Q6U7R4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Timd4Q6U7R4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Timd4Q6U7R4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Timd4Q6U7R4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Timd4Q6U7R4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Timd4Q6U7R4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Timd4Q6U7R4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Timd4Q6U7R4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Timd4Q6U7R4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Timd4Q6U7R4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Timd4Q6U7R4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Timd4Q6U7R4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Timd4Q6U7R4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Timd4Q6U7R4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Timd4Q6U7R4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Timd4Q6U7R4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Timd4Q6U7R4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Timd4Q6U7R4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Timd4Q6U7R4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Timd4Q6U7R4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Timd4Q6U7R4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Timd4Q6U7R4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Timd4Q6U7R4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Timd4Q6U7R4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Timd4Q6U7R4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Timd4Q6U7R4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Timd4Q6U7R4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Timd4Q6U7R4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Timd4Q6U7R4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Timd4Q6U7R4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Timd4Q6U7R4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Timd4Q6U7R4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Timd4Q6U7R4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Timd4Q6U7R4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Timd4Q6U7R4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Timd4Q6U7R4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Timd4Q6U7R4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Timd4Q6U7R4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Timd4Q6U7R4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Timd4Q6U7R4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Timd4Q6U7R4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Timd4Q6U7R4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Timd4Q6U7R4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Timd4Q6U7R4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Timd4Q6U7R4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Timd4Q6U7R4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Timd4Q6U7R4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Timd4Q6U7R4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Timd4Q6U7R4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Timd4Q6U7R4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Timd4Q6U7R4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Timd4Q6U7R4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Timd4Q6U7R4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Timd4Q6U7R4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Timd4Q6U7R4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Timd4Q6U7R4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 269.3 ms