Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFX8

Rimkla, N-acetylaspartylglutamate synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RimklaQ6PFX8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RimklaQ6PFX8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RimklaQ6PFX8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RimklaQ6PFX8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RimklaQ6PFX8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RimklaQ6PFX8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RimklaQ6PFX8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RimklaQ6PFX8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RimklaQ6PFX8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RimklaQ6PFX8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RimklaQ6PFX8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RimklaQ6PFX8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RimklaQ6PFX8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RimklaQ6PFX8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RimklaQ6PFX8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RimklaQ6PFX8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RimklaQ6PFX8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RimklaQ6PFX8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RimklaQ6PFX8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RimklaQ6PFX8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RimklaQ6PFX8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RimklaQ6PFX8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RimklaQ6PFX8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RimklaQ6PFX8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RimklaQ6PFX8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RimklaQ6PFX8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RimklaQ6PFX8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RimklaQ6PFX8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RimklaQ6PFX8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RimklaQ6PFX8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RimklaQ6PFX8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RimklaQ6PFX8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RimklaQ6PFX8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RimklaQ6PFX8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RimklaQ6PFX8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RimklaQ6PFX8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RimklaQ6PFX8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RimklaQ6PFX8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RimklaQ6PFX8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RimklaQ6PFX8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RimklaQ6PFX8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RimklaQ6PFX8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RimklaQ6PFX8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RimklaQ6PFX8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RimklaQ6PFX8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RimklaQ6PFX8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RimklaQ6PFX8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RimklaQ6PFX8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RimklaQ6PFX8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RimklaQ6PFX8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RimklaQ6PFX8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RimklaQ6PFX8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RimklaQ6PFX8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RimklaQ6PFX8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RimklaQ6PFX8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RimklaQ6PFX8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RimklaQ6PFX8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RimklaQ6PFX8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RimklaQ6PFX8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RimklaQ6PFX8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RimklaQ6PFX8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RimklaQ6PFX8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RimklaQ6PFX8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RimklaQ6PFX8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RimklaQ6PFX8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RimklaQ6PFX8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RimklaQ6PFX8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RimklaQ6PFX8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RimklaQ6PFX8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RimklaQ6PFX8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RimklaQ6PFX8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RimklaQ6PFX8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RimklaQ6PFX8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RimklaQ6PFX8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RimklaQ6PFX8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RimklaQ6PFX8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RimklaQ6PFX8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RimklaQ6PFX8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RimklaQ6PFX8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RimklaQ6PFX8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RimklaQ6PFX8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RimklaQ6PFX8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RimklaQ6PFX8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RimklaQ6PFX8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RimklaQ6PFX8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RimklaQ6PFX8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RimklaQ6PFX8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RimklaQ6PFX8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RimklaQ6PFX8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RimklaQ6PFX8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RimklaQ6PFX8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RimklaQ6PFX8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RimklaQ6PFX8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RimklaQ6PFX8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RimklaQ6PFX8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RimklaQ6PFX8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RimklaQ6PFX8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RimklaQ6PFX8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RimklaQ6PFX8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RimklaQ6PFX8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms