Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Cachd1Q6PDJ1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Cachd1Q6PDJ1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Cachd1Q6PDJ1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Cachd1Q6PDJ1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26,27■■□□□ 1,8
Cachd1Q6PDJ1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Cachd1Q6PDJ1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Cachd1Q6PDJ1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Cachd1Q6PDJ1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,21■■□□□ 1,79
Cachd1Q6PDJ1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26,21■■□□□ 1,79
Cachd1Q6PDJ1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Cachd1Q6PDJ1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Cachd1Q6PDJ1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Cachd1Q6PDJ1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Cachd1Q6PDJ1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,17■■□□□ 1,78
Cachd1Q6PDJ1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Cachd1Q6PDJ1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Cachd1Q6PDJ1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Cachd1Q6PDJ1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26,13■■□□□ 1,77
Cachd1Q6PDJ1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Cachd1Q6PDJ1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Cachd1Q6PDJ1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26,12■■□□□ 1,77
Cachd1Q6PDJ1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Cachd1Q6PDJ1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Cachd1Q6PDJ1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Cachd1Q6PDJ1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Cachd1Q6PDJ1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Cachd1Q6PDJ1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Cachd1Q6PDJ1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Cachd1Q6PDJ1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Cachd1Q6PDJ1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Cachd1Q6PDJ1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26,01■■□□□ 1,75
Cachd1Q6PDJ1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,99■■□□□ 1,75
Cachd1Q6PDJ1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Cachd1Q6PDJ1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Cachd1Q6PDJ1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Cachd1Q6PDJ1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Cachd1Q6PDJ1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Cachd1Q6PDJ1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Cachd1Q6PDJ1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Cachd1Q6PDJ1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Cachd1Q6PDJ1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Cachd1Q6PDJ1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Cachd1Q6PDJ1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Cachd1Q6PDJ1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Cachd1Q6PDJ1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Cachd1Q6PDJ1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Cachd1Q6PDJ1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Cachd1Q6PDJ1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Cachd1Q6PDJ1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25,9■■□□□ 1,74
Cachd1Q6PDJ1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25,9■■□□□ 1,74
Cachd1Q6PDJ1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25,89■■□□□ 1,74
Cachd1Q6PDJ1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Cachd1Q6PDJ1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Cachd1Q6PDJ1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Cachd1Q6PDJ1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Cachd1Q6PDJ1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Cachd1Q6PDJ1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25,86■■□□□ 1,73
Cachd1Q6PDJ1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Cachd1Q6PDJ1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Cachd1Q6PDJ1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Cachd1Q6PDJ1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Cachd1Q6PDJ1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Cachd1Q6PDJ1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Cachd1Q6PDJ1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Cachd1Q6PDJ1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Cachd1Q6PDJ1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Cachd1Q6PDJ1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Cachd1Q6PDJ1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Cachd1Q6PDJ1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Cachd1Q6PDJ1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Cachd1Q6PDJ1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Cachd1Q6PDJ1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Cachd1Q6PDJ1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Cachd1Q6PDJ1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Cachd1Q6PDJ1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25,74■■□□□ 1,71
Cachd1Q6PDJ1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Cachd1Q6PDJ1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Cachd1Q6PDJ1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Cachd1Q6PDJ1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Cachd1Q6PDJ1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Cachd1Q6PDJ1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Cachd1Q6PDJ1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Cachd1Q6PDJ1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Cachd1Q6PDJ1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Cachd1Q6PDJ1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Cachd1Q6PDJ1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Cachd1Q6PDJ1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Cachd1Q6PDJ1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Cachd1Q6PDJ1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Cachd1Q6PDJ1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Cachd1Q6PDJ1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Cachd1Q6PDJ1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Cachd1Q6PDJ1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Cachd1Q6PDJ1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Cachd1Q6PDJ1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Cachd1Q6PDJ1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25,59■■□□□ 1,69
Cachd1Q6PDJ1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Cachd1Q6PDJ1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Cachd1Q6PDJ1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms