Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atg2aQ6P4T0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atg2aQ6P4T0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Atg2aQ6P4T0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atg2aQ6P4T0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atg2aQ6P4T0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Atg2aQ6P4T0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Atg2aQ6P4T0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atg2aQ6P4T0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atg2aQ6P4T0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atg2aQ6P4T0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atg2aQ6P4T0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atg2aQ6P4T0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atg2aQ6P4T0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atg2aQ6P4T0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atg2aQ6P4T0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atg2aQ6P4T0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atg2aQ6P4T0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atg2aQ6P4T0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg2aQ6P4T0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg2aQ6P4T0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atg2aQ6P4T0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atg2aQ6P4T0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg2aQ6P4T0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atg2aQ6P4T0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atg2aQ6P4T0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atg2aQ6P4T0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atg2aQ6P4T0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atg2aQ6P4T0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atg2aQ6P4T0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atg2aQ6P4T0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Atg2aQ6P4T0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atg2aQ6P4T0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atg2aQ6P4T0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg2aQ6P4T0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg2aQ6P4T0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg2aQ6P4T0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg2aQ6P4T0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg2aQ6P4T0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg2aQ6P4T0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg2aQ6P4T0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atg2aQ6P4T0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Atg2aQ6P4T0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atg2aQ6P4T0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atg2aQ6P4T0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atg2aQ6P4T0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atg2aQ6P4T0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atg2aQ6P4T0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atg2aQ6P4T0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Atg2aQ6P4T0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atg2aQ6P4T0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atg2aQ6P4T0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atg2aQ6P4T0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atg2aQ6P4T0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atg2aQ6P4T0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atg2aQ6P4T0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atg2aQ6P4T0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atg2aQ6P4T0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atg2aQ6P4T0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atg2aQ6P4T0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atg2aQ6P4T0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atg2aQ6P4T0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atg2aQ6P4T0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atg2aQ6P4T0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Atg2aQ6P4T0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atg2aQ6P4T0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atg2aQ6P4T0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atg2aQ6P4T0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atg2aQ6P4T0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Atg2aQ6P4T0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atg2aQ6P4T0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atg2aQ6P4T0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atg2aQ6P4T0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atg2aQ6P4T0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atg2aQ6P4T0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atg2aQ6P4T0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atg2aQ6P4T0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atg2aQ6P4T0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atg2aQ6P4T0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atg2aQ6P4T0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atg2aQ6P4T0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atg2aQ6P4T0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atg2aQ6P4T0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atg2aQ6P4T0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atg2aQ6P4T0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atg2aQ6P4T0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atg2aQ6P4T0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atg2aQ6P4T0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atg2aQ6P4T0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atg2aQ6P4T0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atg2aQ6P4T0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atg2aQ6P4T0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atg2aQ6P4T0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atg2aQ6P4T0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atg2aQ6P4T0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atg2aQ6P4T0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atg2aQ6P4T0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atg2aQ6P4T0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atg2aQ6P4T0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atg2aQ6P4T0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms