Protein–RNA interactions for Protein: Q6P205

Xlr3b, X-linked lymphocyte-regulated protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr3bQ6P205 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xlr3bQ6P205 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Xlr3bQ6P205 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Xlr3bQ6P205 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Xlr3bQ6P205 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Xlr3bQ6P205 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xlr3bQ6P205 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xlr3bQ6P205 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xlr3bQ6P205 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xlr3bQ6P205 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xlr3bQ6P205 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Xlr3bQ6P205 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Xlr3bQ6P205 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Xlr3bQ6P205 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xlr3bQ6P205 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Xlr3bQ6P205 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Xlr3bQ6P205 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Xlr3bQ6P205 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Xlr3bQ6P205 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Xlr3bQ6P205 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Xlr3bQ6P205 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Xlr3bQ6P205 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Xlr3bQ6P205 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xlr3bQ6P205 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xlr3bQ6P205 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Xlr3bQ6P205 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xlr3bQ6P205 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xlr3bQ6P205 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Xlr3bQ6P205 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Xlr3bQ6P205 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xlr3bQ6P205 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xlr3bQ6P205 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Xlr3bQ6P205 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Xlr3bQ6P205 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Xlr3bQ6P205 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Xlr3bQ6P205 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Xlr3bQ6P205 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Xlr3bQ6P205 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xlr3bQ6P205 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Xlr3bQ6P205 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Xlr3bQ6P205 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Xlr3bQ6P205 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Xlr3bQ6P205 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Xlr3bQ6P205 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Xlr3bQ6P205 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Xlr3bQ6P205 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Xlr3bQ6P205 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Xlr3bQ6P205 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Xlr3bQ6P205 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Xlr3bQ6P205 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Xlr3bQ6P205 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Xlr3bQ6P205 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Xlr3bQ6P205 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Xlr3bQ6P205 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Xlr3bQ6P205 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Xlr3bQ6P205 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Xlr3bQ6P205 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Xlr3bQ6P205 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Xlr3bQ6P205 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Xlr3bQ6P205 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Xlr3bQ6P205 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Xlr3bQ6P205 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Xlr3bQ6P205 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Xlr3bQ6P205 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Xlr3bQ6P205 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Xlr3bQ6P205 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Xlr3bQ6P205 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Xlr3bQ6P205 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Xlr3bQ6P205 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Xlr3bQ6P205 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Xlr3bQ6P205 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Xlr3bQ6P205 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Xlr3bQ6P205 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Xlr3bQ6P205 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Xlr3bQ6P205 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Xlr3bQ6P205 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Xlr3bQ6P205 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Xlr3bQ6P205 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Xlr3bQ6P205 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Xlr3bQ6P205 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Xlr3bQ6P205 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Xlr3bQ6P205 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Xlr3bQ6P205 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Xlr3bQ6P205 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Xlr3bQ6P205 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Xlr3bQ6P205 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Xlr3bQ6P205 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Xlr3bQ6P205 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Xlr3bQ6P205 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Xlr3bQ6P205 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Xlr3bQ6P205 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Xlr3bQ6P205 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Xlr3bQ6P205 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Xlr3bQ6P205 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Xlr3bQ6P205 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Xlr3bQ6P205 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xlr3bQ6P205 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xlr3bQ6P205 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Xlr3bQ6P205 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Xlr3bQ6P205 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms