Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rtl3Q6P1Y1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rtl3Q6P1Y1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rtl3Q6P1Y1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rtl3Q6P1Y1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rtl3Q6P1Y1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rtl3Q6P1Y1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rtl3Q6P1Y1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rtl3Q6P1Y1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rtl3Q6P1Y1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rtl3Q6P1Y1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rtl3Q6P1Y1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rtl3Q6P1Y1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rtl3Q6P1Y1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rtl3Q6P1Y1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rtl3Q6P1Y1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rtl3Q6P1Y1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rtl3Q6P1Y1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rtl3Q6P1Y1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Rtl3Q6P1Y1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rtl3Q6P1Y1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rtl3Q6P1Y1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rtl3Q6P1Y1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rtl3Q6P1Y1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rtl3Q6P1Y1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rtl3Q6P1Y1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rtl3Q6P1Y1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rtl3Q6P1Y1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtl3Q6P1Y1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtl3Q6P1Y1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtl3Q6P1Y1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtl3Q6P1Y1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtl3Q6P1Y1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rtl3Q6P1Y1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rtl3Q6P1Y1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rtl3Q6P1Y1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rtl3Q6P1Y1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rtl3Q6P1Y1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rtl3Q6P1Y1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rtl3Q6P1Y1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Rtl3Q6P1Y1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rtl3Q6P1Y1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtl3Q6P1Y1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtl3Q6P1Y1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtl3Q6P1Y1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtl3Q6P1Y1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtl3Q6P1Y1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtl3Q6P1Y1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rtl3Q6P1Y1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rtl3Q6P1Y1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rtl3Q6P1Y1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rtl3Q6P1Y1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rtl3Q6P1Y1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rtl3Q6P1Y1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rtl3Q6P1Y1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rtl3Q6P1Y1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rtl3Q6P1Y1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rtl3Q6P1Y1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rtl3Q6P1Y1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rtl3Q6P1Y1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rtl3Q6P1Y1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rtl3Q6P1Y1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rtl3Q6P1Y1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rtl3Q6P1Y1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rtl3Q6P1Y1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rtl3Q6P1Y1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rtl3Q6P1Y1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rtl3Q6P1Y1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rtl3Q6P1Y1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rtl3Q6P1Y1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rtl3Q6P1Y1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rtl3Q6P1Y1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rtl3Q6P1Y1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rtl3Q6P1Y1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Rtl3Q6P1Y1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rtl3Q6P1Y1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rtl3Q6P1Y1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rtl3Q6P1Y1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rtl3Q6P1Y1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Rtl3Q6P1Y1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rtl3Q6P1Y1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rtl3Q6P1Y1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rtl3Q6P1Y1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rtl3Q6P1Y1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rtl3Q6P1Y1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rtl3Q6P1Y1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rtl3Q6P1Y1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rtl3Q6P1Y1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rtl3Q6P1Y1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rtl3Q6P1Y1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rtl3Q6P1Y1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rtl3Q6P1Y1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rtl3Q6P1Y1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rtl3Q6P1Y1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rtl3Q6P1Y1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rtl3Q6P1Y1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rtl3Q6P1Y1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rtl3Q6P1Y1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rtl3Q6P1Y1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtl3Q6P1Y1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms