Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sec23ipQ6NZC7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sec23ipQ6NZC7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sec23ipQ6NZC7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sec23ipQ6NZC7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sec23ipQ6NZC7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sec23ipQ6NZC7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sec23ipQ6NZC7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sec23ipQ6NZC7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sec23ipQ6NZC7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sec23ipQ6NZC7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sec23ipQ6NZC7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sec23ipQ6NZC7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sec23ipQ6NZC7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sec23ipQ6NZC7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sec23ipQ6NZC7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sec23ipQ6NZC7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sec23ipQ6NZC7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sec23ipQ6NZC7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sec23ipQ6NZC7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Sec23ipQ6NZC7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sec23ipQ6NZC7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sec23ipQ6NZC7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sec23ipQ6NZC7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sec23ipQ6NZC7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sec23ipQ6NZC7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sec23ipQ6NZC7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sec23ipQ6NZC7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sec23ipQ6NZC7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sec23ipQ6NZC7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sec23ipQ6NZC7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sec23ipQ6NZC7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Sec23ipQ6NZC7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Sec23ipQ6NZC7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sec23ipQ6NZC7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Sec23ipQ6NZC7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sec23ipQ6NZC7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sec23ipQ6NZC7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sec23ipQ6NZC7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sec23ipQ6NZC7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sec23ipQ6NZC7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sec23ipQ6NZC7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sec23ipQ6NZC7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sec23ipQ6NZC7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sec23ipQ6NZC7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sec23ipQ6NZC7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sec23ipQ6NZC7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sec23ipQ6NZC7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sec23ipQ6NZC7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sec23ipQ6NZC7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sec23ipQ6NZC7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Sec23ipQ6NZC7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sec23ipQ6NZC7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sec23ipQ6NZC7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sec23ipQ6NZC7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sec23ipQ6NZC7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sec23ipQ6NZC7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sec23ipQ6NZC7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sec23ipQ6NZC7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sec23ipQ6NZC7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sec23ipQ6NZC7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sec23ipQ6NZC7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sec23ipQ6NZC7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sec23ipQ6NZC7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sec23ipQ6NZC7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sec23ipQ6NZC7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sec23ipQ6NZC7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sec23ipQ6NZC7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sec23ipQ6NZC7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sec23ipQ6NZC7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Sec23ipQ6NZC7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sec23ipQ6NZC7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sec23ipQ6NZC7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sec23ipQ6NZC7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sec23ipQ6NZC7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sec23ipQ6NZC7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sec23ipQ6NZC7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Sec23ipQ6NZC7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sec23ipQ6NZC7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sec23ipQ6NZC7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sec23ipQ6NZC7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sec23ipQ6NZC7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sec23ipQ6NZC7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sec23ipQ6NZC7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Sec23ipQ6NZC7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sec23ipQ6NZC7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sec23ipQ6NZC7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sec23ipQ6NZC7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sec23ipQ6NZC7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sec23ipQ6NZC7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sec23ipQ6NZC7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sec23ipQ6NZC7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sec23ipQ6NZC7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sec23ipQ6NZC7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Sec23ipQ6NZC7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sec23ipQ6NZC7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sec23ipQ6NZC7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sec23ipQ6NZC7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sec23ipQ6NZC7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Sec23ipQ6NZC7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms