Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Nckap5lQ6GQX2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC34,6■■■■□ 3,13
Nckap5lQ6GQX2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Nckap5lQ6GQX2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC34,6■■■■□ 3,13
Nckap5lQ6GQX2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Nckap5lQ6GQX2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Nckap5lQ6GQX2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,56■■■■□ 3,12
Nckap5lQ6GQX2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Nckap5lQ6GQX2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Nckap5lQ6GQX2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Nckap5lQ6GQX2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC34,55■■■■□ 3,12
Nckap5lQ6GQX2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Nckap5lQ6GQX2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC34,54■■■■□ 3,12
Nckap5lQ6GQX2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,52■■■■□ 3,12
Nckap5lQ6GQX2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC34,51■■■■□ 3,11
Nckap5lQ6GQX2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Nckap5lQ6GQX2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34,5■■■■□ 3,11
Nckap5lQ6GQX2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC34,5■■■■□ 3,11
Nckap5lQ6GQX2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Nckap5lQ6GQX2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34,48■■■■□ 3,11
Nckap5lQ6GQX2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Nckap5lQ6GQX2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Nckap5lQ6GQX2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34,44■■■■□ 3,1
Nckap5lQ6GQX2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Nckap5lQ6GQX2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC34,32■■■■□ 3,09
Nckap5lQ6GQX2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,08
Nckap5lQ6GQX2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Nckap5lQ6GQX2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Nckap5lQ6GQX2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Nckap5lQ6GQX2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Nckap5lQ6GQX2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34,29■■■■□ 3,08
Nckap5lQ6GQX2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Nckap5lQ6GQX2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,07
Nckap5lQ6GQX2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34,26■■■■□ 3,07
Nckap5lQ6GQX2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,07
Nckap5lQ6GQX2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Nckap5lQ6GQX2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,21■■■■□ 3,07
Nckap5lQ6GQX2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Nckap5lQ6GQX2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Nckap5lQ6GQX2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Nckap5lQ6GQX2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Nckap5lQ6GQX2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Nckap5lQ6GQX2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Nckap5lQ6GQX2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC34,15■■■■□ 3,06
Nckap5lQ6GQX2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC34,15■■■■□ 3,06
Nckap5lQ6GQX2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Nckap5lQ6GQX2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Nckap5lQ6GQX2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Nckap5lQ6GQX2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,13■■■■□ 3,05
Nckap5lQ6GQX2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Nckap5lQ6GQX2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34,12■■■■□ 3,05
Nckap5lQ6GQX2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34,12■■■■□ 3,05
Nckap5lQ6GQX2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Nckap5lQ6GQX2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Nckap5lQ6GQX2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Nckap5lQ6GQX2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,07■■■■□ 3,05
Nckap5lQ6GQX2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Nckap5lQ6GQX2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Nckap5lQ6GQX2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC34,07■■■■□ 3,04
Nckap5lQ6GQX2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC34,05■■■■□ 3,04
Nckap5lQ6GQX2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC34,04■■■■□ 3,04
Nckap5lQ6GQX2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC34,04■■■■□ 3,04
Nckap5lQ6GQX2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Nckap5lQ6GQX2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Nckap5lQ6GQX2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Nckap5lQ6GQX2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Nckap5lQ6GQX2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC34,02■■■■□ 3,04
Nckap5lQ6GQX2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Nckap5lQ6GQX2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Nckap5lQ6GQX2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Nckap5lQ6GQX2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Nckap5lQ6GQX2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Nckap5lQ6GQX2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC33,96■■■■□ 3,03
Nckap5lQ6GQX2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC33,94■■■■□ 3,02
Nckap5lQ6GQX2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Nckap5lQ6GQX2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33,93■■■■□ 3,02
Nckap5lQ6GQX2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Nckap5lQ6GQX2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Nckap5lQ6GQX2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,88■■■■□ 3,01
Nckap5lQ6GQX2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33,88■■■■□ 3,01
Nckap5lQ6GQX2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Nckap5lQ6GQX2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Nckap5lQ6GQX2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Nckap5lQ6GQX2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33,86■■■■□ 3,01
Nckap5lQ6GQX2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Nckap5lQ6GQX2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Nckap5lQ6GQX2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC33,84■■■■□ 3,01
Nckap5lQ6GQX2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Nckap5lQ6GQX2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,84■■■■□ 3,01
Nckap5lQ6GQX2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,83■■■■□ 3,01
Nckap5lQ6GQX2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Nckap5lQ6GQX2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Nckap5lQ6GQX2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Nckap5lQ6GQX2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Nckap5lQ6GQX2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Nckap5lQ6GQX2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Nckap5lQ6GQX2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC33,76■■■□□ 2,99
Nckap5lQ6GQX2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Nckap5lQ6GQX2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,74■■■□□ 2,99
Nckap5lQ6GQX2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms