Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU6

Lingo3, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo3Q6GQU6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lingo3Q6GQU6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lingo3Q6GQU6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lingo3Q6GQU6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lingo3Q6GQU6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lingo3Q6GQU6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lingo3Q6GQU6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lingo3Q6GQU6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lingo3Q6GQU6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Lingo3Q6GQU6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lingo3Q6GQU6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lingo3Q6GQU6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lingo3Q6GQU6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lingo3Q6GQU6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lingo3Q6GQU6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lingo3Q6GQU6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lingo3Q6GQU6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Lingo3Q6GQU6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lingo3Q6GQU6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lingo3Q6GQU6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lingo3Q6GQU6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lingo3Q6GQU6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lingo3Q6GQU6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lingo3Q6GQU6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lingo3Q6GQU6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lingo3Q6GQU6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lingo3Q6GQU6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lingo3Q6GQU6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lingo3Q6GQU6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lingo3Q6GQU6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Lingo3Q6GQU6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lingo3Q6GQU6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lingo3Q6GQU6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lingo3Q6GQU6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lingo3Q6GQU6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lingo3Q6GQU6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lingo3Q6GQU6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lingo3Q6GQU6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lingo3Q6GQU6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lingo3Q6GQU6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lingo3Q6GQU6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lingo3Q6GQU6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lingo3Q6GQU6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lingo3Q6GQU6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lingo3Q6GQU6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lingo3Q6GQU6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lingo3Q6GQU6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lingo3Q6GQU6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lingo3Q6GQU6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lingo3Q6GQU6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lingo3Q6GQU6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lingo3Q6GQU6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lingo3Q6GQU6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Lingo3Q6GQU6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lingo3Q6GQU6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lingo3Q6GQU6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lingo3Q6GQU6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lingo3Q6GQU6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lingo3Q6GQU6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lingo3Q6GQU6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lingo3Q6GQU6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lingo3Q6GQU6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lingo3Q6GQU6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lingo3Q6GQU6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lingo3Q6GQU6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lingo3Q6GQU6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lingo3Q6GQU6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lingo3Q6GQU6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lingo3Q6GQU6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lingo3Q6GQU6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lingo3Q6GQU6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lingo3Q6GQU6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lingo3Q6GQU6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lingo3Q6GQU6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lingo3Q6GQU6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lingo3Q6GQU6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lingo3Q6GQU6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lingo3Q6GQU6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lingo3Q6GQU6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lingo3Q6GQU6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lingo3Q6GQU6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lingo3Q6GQU6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lingo3Q6GQU6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lingo3Q6GQU6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lingo3Q6GQU6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lingo3Q6GQU6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lingo3Q6GQU6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Lingo3Q6GQU6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lingo3Q6GQU6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lingo3Q6GQU6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lingo3Q6GQU6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lingo3Q6GQU6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lingo3Q6GQU6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lingo3Q6GQU6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lingo3Q6GQU6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lingo3Q6GQU6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lingo3Q6GQU6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lingo3Q6GQU6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lingo3Q6GQU6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lingo3Q6GQU6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms