Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Fndc3c1Q6DFV6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Fndc3c1Q6DFV6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fndc3c1Q6DFV6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Fndc3c1Q6DFV6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fndc3c1Q6DFV6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fndc3c1Q6DFV6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fndc3c1Q6DFV6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fndc3c1Q6DFV6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fndc3c1Q6DFV6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fndc3c1Q6DFV6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fndc3c1Q6DFV6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Fndc3c1Q6DFV6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fndc3c1Q6DFV6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fndc3c1Q6DFV6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fndc3c1Q6DFV6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fndc3c1Q6DFV6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fndc3c1Q6DFV6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fndc3c1Q6DFV6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fndc3c1Q6DFV6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fndc3c1Q6DFV6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fndc3c1Q6DFV6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fndc3c1Q6DFV6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fndc3c1Q6DFV6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fndc3c1Q6DFV6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Fndc3c1Q6DFV6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fndc3c1Q6DFV6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fndc3c1Q6DFV6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fndc3c1Q6DFV6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fndc3c1Q6DFV6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fndc3c1Q6DFV6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fndc3c1Q6DFV6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fndc3c1Q6DFV6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fndc3c1Q6DFV6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fndc3c1Q6DFV6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Fndc3c1Q6DFV6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fndc3c1Q6DFV6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fndc3c1Q6DFV6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fndc3c1Q6DFV6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fndc3c1Q6DFV6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fndc3c1Q6DFV6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fndc3c1Q6DFV6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fndc3c1Q6DFV6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Fndc3c1Q6DFV6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fndc3c1Q6DFV6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fndc3c1Q6DFV6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fndc3c1Q6DFV6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fndc3c1Q6DFV6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fndc3c1Q6DFV6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fndc3c1Q6DFV6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fndc3c1Q6DFV6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Fndc3c1Q6DFV6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fndc3c1Q6DFV6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fndc3c1Q6DFV6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fndc3c1Q6DFV6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fndc3c1Q6DFV6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fndc3c1Q6DFV6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fndc3c1Q6DFV6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fndc3c1Q6DFV6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fndc3c1Q6DFV6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fndc3c1Q6DFV6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fndc3c1Q6DFV6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fndc3c1Q6DFV6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Fndc3c1Q6DFV6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fndc3c1Q6DFV6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fndc3c1Q6DFV6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fndc3c1Q6DFV6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fndc3c1Q6DFV6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fndc3c1Q6DFV6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fndc3c1Q6DFV6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fndc3c1Q6DFV6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fndc3c1Q6DFV6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fndc3c1Q6DFV6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fndc3c1Q6DFV6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fndc3c1Q6DFV6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fndc3c1Q6DFV6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fndc3c1Q6DFV6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fndc3c1Q6DFV6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fndc3c1Q6DFV6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fndc3c1Q6DFV6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fndc3c1Q6DFV6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fndc3c1Q6DFV6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fndc3c1Q6DFV6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fndc3c1Q6DFV6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fndc3c1Q6DFV6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Fndc3c1Q6DFV6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Fndc3c1Q6DFV6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fndc3c1Q6DFV6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fndc3c1Q6DFV6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Fndc3c1Q6DFV6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fndc3c1Q6DFV6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fndc3c1Q6DFV6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms