Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rftn1Q6A0D4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rftn1Q6A0D4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rftn1Q6A0D4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rftn1Q6A0D4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Rftn1Q6A0D4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rftn1Q6A0D4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rftn1Q6A0D4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rftn1Q6A0D4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Rftn1Q6A0D4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rftn1Q6A0D4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rftn1Q6A0D4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rftn1Q6A0D4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rftn1Q6A0D4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rftn1Q6A0D4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rftn1Q6A0D4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rftn1Q6A0D4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Rftn1Q6A0D4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rftn1Q6A0D4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rftn1Q6A0D4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rftn1Q6A0D4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Rftn1Q6A0D4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rftn1Q6A0D4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rftn1Q6A0D4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rftn1Q6A0D4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rftn1Q6A0D4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Rftn1Q6A0D4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rftn1Q6A0D4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rftn1Q6A0D4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Rftn1Q6A0D4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rftn1Q6A0D4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rftn1Q6A0D4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rftn1Q6A0D4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rftn1Q6A0D4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rftn1Q6A0D4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rftn1Q6A0D4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rftn1Q6A0D4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rftn1Q6A0D4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rftn1Q6A0D4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rftn1Q6A0D4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rftn1Q6A0D4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rftn1Q6A0D4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rftn1Q6A0D4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rftn1Q6A0D4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rftn1Q6A0D4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rftn1Q6A0D4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rftn1Q6A0D4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rftn1Q6A0D4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rftn1Q6A0D4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rftn1Q6A0D4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rftn1Q6A0D4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Rftn1Q6A0D4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rftn1Q6A0D4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rftn1Q6A0D4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rftn1Q6A0D4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rftn1Q6A0D4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Rftn1Q6A0D4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rftn1Q6A0D4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rftn1Q6A0D4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rftn1Q6A0D4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rftn1Q6A0D4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rftn1Q6A0D4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rftn1Q6A0D4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rftn1Q6A0D4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rftn1Q6A0D4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rftn1Q6A0D4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rftn1Q6A0D4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rftn1Q6A0D4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rftn1Q6A0D4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rftn1Q6A0D4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rftn1Q6A0D4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rftn1Q6A0D4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rftn1Q6A0D4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rftn1Q6A0D4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rftn1Q6A0D4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rftn1Q6A0D4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rftn1Q6A0D4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Rftn1Q6A0D4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rftn1Q6A0D4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rftn1Q6A0D4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rftn1Q6A0D4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rftn1Q6A0D4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rftn1Q6A0D4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rftn1Q6A0D4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rftn1Q6A0D4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rftn1Q6A0D4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rftn1Q6A0D4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rftn1Q6A0D4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rftn1Q6A0D4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rftn1Q6A0D4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rftn1Q6A0D4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rftn1Q6A0D4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rftn1Q6A0D4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rftn1Q6A0D4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rftn1Q6A0D4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rftn1Q6A0D4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rftn1Q6A0D4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Rftn1Q6A0D4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rftn1Q6A0D4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms