Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab3ipQ68EF0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab3ipQ68EF0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab3ipQ68EF0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rab3ipQ68EF0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab3ipQ68EF0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab3ipQ68EF0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab3ipQ68EF0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab3ipQ68EF0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab3ipQ68EF0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab3ipQ68EF0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab3ipQ68EF0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab3ipQ68EF0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab3ipQ68EF0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab3ipQ68EF0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab3ipQ68EF0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab3ipQ68EF0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab3ipQ68EF0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab3ipQ68EF0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab3ipQ68EF0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab3ipQ68EF0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab3ipQ68EF0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rab3ipQ68EF0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab3ipQ68EF0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab3ipQ68EF0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab3ipQ68EF0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab3ipQ68EF0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab3ipQ68EF0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab3ipQ68EF0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rab3ipQ68EF0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab3ipQ68EF0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab3ipQ68EF0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab3ipQ68EF0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab3ipQ68EF0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab3ipQ68EF0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab3ipQ68EF0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab3ipQ68EF0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab3ipQ68EF0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab3ipQ68EF0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab3ipQ68EF0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab3ipQ68EF0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab3ipQ68EF0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab3ipQ68EF0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab3ipQ68EF0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab3ipQ68EF0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab3ipQ68EF0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab3ipQ68EF0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab3ipQ68EF0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab3ipQ68EF0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab3ipQ68EF0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab3ipQ68EF0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rab3ipQ68EF0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab3ipQ68EF0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab3ipQ68EF0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab3ipQ68EF0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab3ipQ68EF0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab3ipQ68EF0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab3ipQ68EF0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab3ipQ68EF0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab3ipQ68EF0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab3ipQ68EF0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab3ipQ68EF0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab3ipQ68EF0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab3ipQ68EF0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab3ipQ68EF0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab3ipQ68EF0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab3ipQ68EF0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab3ipQ68EF0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab3ipQ68EF0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab3ipQ68EF0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab3ipQ68EF0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab3ipQ68EF0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab3ipQ68EF0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab3ipQ68EF0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab3ipQ68EF0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab3ipQ68EF0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab3ipQ68EF0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab3ipQ68EF0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab3ipQ68EF0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab3ipQ68EF0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab3ipQ68EF0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab3ipQ68EF0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab3ipQ68EF0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab3ipQ68EF0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab3ipQ68EF0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab3ipQ68EF0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab3ipQ68EF0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab3ipQ68EF0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab3ipQ68EF0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab3ipQ68EF0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab3ipQ68EF0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab3ipQ68EF0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab3ipQ68EF0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab3ipQ68EF0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab3ipQ68EF0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab3ipQ68EF0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab3ipQ68EF0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab3ipQ68EF0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab3ipQ68EF0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab3ipQ68EF0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms