Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY9

BC080695, cDNA sequence BC080695, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC080695Q66JY9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BC080695Q66JY9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BC080695Q66JY9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BC080695Q66JY9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BC080695Q66JY9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BC080695Q66JY9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BC080695Q66JY9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BC080695Q66JY9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BC080695Q66JY9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BC080695Q66JY9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BC080695Q66JY9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BC080695Q66JY9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BC080695Q66JY9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC080695Q66JY9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC080695Q66JY9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BC080695Q66JY9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BC080695Q66JY9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BC080695Q66JY9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BC080695Q66JY9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BC080695Q66JY9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BC080695Q66JY9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC080695Q66JY9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BC080695Q66JY9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BC080695Q66JY9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BC080695Q66JY9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BC080695Q66JY9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BC080695Q66JY9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BC080695Q66JY9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BC080695Q66JY9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BC080695Q66JY9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BC080695Q66JY9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BC080695Q66JY9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BC080695Q66JY9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BC080695Q66JY9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BC080695Q66JY9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BC080695Q66JY9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BC080695Q66JY9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BC080695Q66JY9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BC080695Q66JY9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BC080695Q66JY9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BC080695Q66JY9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BC080695Q66JY9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BC080695Q66JY9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BC080695Q66JY9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BC080695Q66JY9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BC080695Q66JY9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BC080695Q66JY9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC080695Q66JY9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BC080695Q66JY9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC080695Q66JY9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC080695Q66JY9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC080695Q66JY9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC080695Q66JY9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC080695Q66JY9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC080695Q66JY9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC080695Q66JY9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC080695Q66JY9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC080695Q66JY9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC080695Q66JY9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC080695Q66JY9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC080695Q66JY9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC080695Q66JY9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC080695Q66JY9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC080695Q66JY9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC080695Q66JY9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC080695Q66JY9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC080695Q66JY9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC080695Q66JY9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC080695Q66JY9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BC080695Q66JY9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BC080695Q66JY9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BC080695Q66JY9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BC080695Q66JY9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BC080695Q66JY9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC080695Q66JY9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BC080695Q66JY9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC080695Q66JY9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC080695Q66JY9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC080695Q66JY9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC080695Q66JY9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC080695Q66JY9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC080695Q66JY9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC080695Q66JY9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC080695Q66JY9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC080695Q66JY9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC080695Q66JY9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC080695Q66JY9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC080695Q66JY9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC080695Q66JY9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC080695Q66JY9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC080695Q66JY9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC080695Q66JY9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC080695Q66JY9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC080695Q66JY9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC080695Q66JY9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC080695Q66JY9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC080695Q66JY9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC080695Q66JY9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC080695Q66JY9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC080695Q66JY9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms