Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VclQ64727 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VclQ64727 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VclQ64727 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VclQ64727 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VclQ64727 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VclQ64727 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VclQ64727 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VclQ64727 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VclQ64727 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VclQ64727 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VclQ64727 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VclQ64727 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VclQ64727 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VclQ64727 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VclQ64727 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VclQ64727 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VclQ64727 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VclQ64727 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VclQ64727 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VclQ64727 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VclQ64727 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VclQ64727 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VclQ64727 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VclQ64727 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VclQ64727 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VclQ64727 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VclQ64727 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VclQ64727 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VclQ64727 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VclQ64727 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VclQ64727 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VclQ64727 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VclQ64727 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VclQ64727 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VclQ64727 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VclQ64727 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VclQ64727 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VclQ64727 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VclQ64727 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VclQ64727 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VclQ64727 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VclQ64727 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VclQ64727 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VclQ64727 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VclQ64727 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VclQ64727 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VclQ64727 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VclQ64727 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VclQ64727 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VclQ64727 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VclQ64727 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VclQ64727 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VclQ64727 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VclQ64727 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VclQ64727 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VclQ64727 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VclQ64727 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VclQ64727 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VclQ64727 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VclQ64727 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VclQ64727 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VclQ64727 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VclQ64727 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VclQ64727 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VclQ64727 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VclQ64727 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VclQ64727 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VclQ64727 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VclQ64727 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VclQ64727 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VclQ64727 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VclQ64727 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VclQ64727 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VclQ64727 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VclQ64727 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VclQ64727 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VclQ64727 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VclQ64727 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VclQ64727 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VclQ64727 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VclQ64727 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VclQ64727 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VclQ64727 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VclQ64727 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VclQ64727 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VclQ64727 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VclQ64727 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VclQ64727 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VclQ64727 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VclQ64727 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VclQ64727 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VclQ64727 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VclQ64727 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VclQ64727 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VclQ64727 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VclQ64727 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VclQ64727 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VclQ64727 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VclQ64727 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms