Protein–RNA interactions for Protein: Q64318

Zeb1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb1Q64318 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC41.85■■■■■ 4.29
Zeb1Q64318 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC41.85■■■■■ 4.29
Zeb1Q64318 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
Zeb1Q64318 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Zeb1Q64318 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
Zeb1Q64318 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Zeb1Q64318 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
Zeb1Q64318 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
Zeb1Q64318 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Zeb1Q64318 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Zeb1Q64318 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Zeb1Q64318 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC41.7■■■■■ 4.27
Zeb1Q64318 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC41.68■■■■■ 4.26
Zeb1Q64318 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Zeb1Q64318 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Zeb1Q64318 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Zeb1Q64318 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
Zeb1Q64318 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Zeb1Q64318 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Zeb1Q64318 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Zeb1Q64318 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
Zeb1Q64318 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
Zeb1Q64318 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Zeb1Q64318 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
Zeb1Q64318 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
Zeb1Q64318 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Zeb1Q64318 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Zeb1Q64318 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Zeb1Q64318 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Zeb1Q64318 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Zeb1Q64318 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
Zeb1Q64318 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Zeb1Q64318 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
Zeb1Q64318 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Zeb1Q64318 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Zeb1Q64318 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Zeb1Q64318 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Zeb1Q64318 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Zeb1Q64318 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Zeb1Q64318 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Zeb1Q64318 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Zeb1Q64318 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Zeb1Q64318 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Zeb1Q64318 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Zeb1Q64318 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
Zeb1Q64318 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC41.33■■■■■ 4.21
Zeb1Q64318 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Zeb1Q64318 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
Zeb1Q64318 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
Zeb1Q64318 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
Zeb1Q64318 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Zeb1Q64318 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Zeb1Q64318 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
Zeb1Q64318 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Zeb1Q64318 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Zeb1Q64318 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC41.23■■■■■ 4.19
Zeb1Q64318 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Zeb1Q64318 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Zeb1Q64318 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Zeb1Q64318 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Zeb1Q64318 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
Zeb1Q64318 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Zeb1Q64318 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Zeb1Q64318 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
Zeb1Q64318 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
Zeb1Q64318 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
Zeb1Q64318 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
Zeb1Q64318 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Zeb1Q64318 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Zeb1Q64318 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Zeb1Q64318 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Zeb1Q64318 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Zeb1Q64318 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Zeb1Q64318 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Zeb1Q64318 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Zeb1Q64318 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Zeb1Q64318 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Zeb1Q64318 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
Zeb1Q64318 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC41.01■■■■■ 4.16
Zeb1Q64318 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Zeb1Q64318 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Zeb1Q64318 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Zeb1Q64318 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Zeb1Q64318 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Zeb1Q64318 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Zeb1Q64318 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Zeb1Q64318 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
Zeb1Q64318 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Zeb1Q64318 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Zeb1Q64318 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Zeb1Q64318 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Zeb1Q64318 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Zeb1Q64318 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Zeb1Q64318 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
Zeb1Q64318 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Zeb1Q64318 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
Zeb1Q64318 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Zeb1Q64318 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Zeb1Q64318 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Zeb1Q64318 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms