Protein–RNA interactions for Protein: Q64096

Mcf2l, Guanine nucleotide exchange factor DBS, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcf2lQ64096 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Mcf2lQ64096 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mcf2lQ64096 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mcf2lQ64096 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mcf2lQ64096 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mcf2lQ64096 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mcf2lQ64096 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mcf2lQ64096 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mcf2lQ64096 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mcf2lQ64096 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mcf2lQ64096 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mcf2lQ64096 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mcf2lQ64096 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mcf2lQ64096 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mcf2lQ64096 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mcf2lQ64096 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mcf2lQ64096 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mcf2lQ64096 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mcf2lQ64096 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mcf2lQ64096 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mcf2lQ64096 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mcf2lQ64096 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mcf2lQ64096 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mcf2lQ64096 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mcf2lQ64096 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mcf2lQ64096 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mcf2lQ64096 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mcf2lQ64096 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Mcf2lQ64096 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mcf2lQ64096 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Mcf2lQ64096 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mcf2lQ64096 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mcf2lQ64096 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mcf2lQ64096 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mcf2lQ64096 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mcf2lQ64096 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mcf2lQ64096 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mcf2lQ64096 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mcf2lQ64096 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mcf2lQ64096 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mcf2lQ64096 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mcf2lQ64096 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mcf2lQ64096 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mcf2lQ64096 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mcf2lQ64096 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mcf2lQ64096 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mcf2lQ64096 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mcf2lQ64096 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mcf2lQ64096 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mcf2lQ64096 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mcf2lQ64096 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mcf2lQ64096 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mcf2lQ64096 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mcf2lQ64096 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mcf2lQ64096 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mcf2lQ64096 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mcf2lQ64096 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mcf2lQ64096 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mcf2lQ64096 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mcf2lQ64096 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mcf2lQ64096 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mcf2lQ64096 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mcf2lQ64096 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Mcf2lQ64096 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Mcf2lQ64096 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mcf2lQ64096 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mcf2lQ64096 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mcf2lQ64096 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Mcf2lQ64096 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mcf2lQ64096 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mcf2lQ64096 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mcf2lQ64096 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mcf2lQ64096 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Mcf2lQ64096 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mcf2lQ64096 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mcf2lQ64096 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mcf2lQ64096 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mcf2lQ64096 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mcf2lQ64096 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mcf2lQ64096 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mcf2lQ64096 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mcf2lQ64096 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Mcf2lQ64096 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mcf2lQ64096 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mcf2lQ64096 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mcf2lQ64096 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mcf2lQ64096 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mcf2lQ64096 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mcf2lQ64096 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mcf2lQ64096 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mcf2lQ64096 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mcf2lQ64096 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mcf2lQ64096 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Mcf2lQ64096 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mcf2lQ64096 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mcf2lQ64096 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mcf2lQ64096 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mcf2lQ64096 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mcf2lQ64096 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Mcf2lQ64096 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms