Protein–RNA interactions for Protein: Q62376

Snrnp70, U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp70Q62376 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp70Q62376 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp70Q62376 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp70Q62376 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp70Q62376 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp70Q62376 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp70Q62376 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp70Q62376 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp70Q62376 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrnp70Q62376 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp70Q62376 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp70Q62376 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp70Q62376 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp70Q62376 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrnp70Q62376 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrnp70Q62376 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrnp70Q62376 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrnp70Q62376 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrnp70Q62376 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrnp70Q62376 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrnp70Q62376 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrnp70Q62376 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrnp70Q62376 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrnp70Q62376 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrnp70Q62376 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrnp70Q62376 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrnp70Q62376 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp70Q62376 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp70Q62376 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp70Q62376 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp70Q62376 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrnp70Q62376 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrnp70Q62376 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrnp70Q62376 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snrnp70Q62376 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrnp70Q62376 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrnp70Q62376 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Snrnp70Q62376 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snrnp70Q62376 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrnp70Q62376 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrnp70Q62376 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrnp70Q62376 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrnp70Q62376 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrnp70Q62376 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrnp70Q62376 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrnp70Q62376 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrnp70Q62376 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrnp70Q62376 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrnp70Q62376 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrnp70Q62376 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrnp70Q62376 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrnp70Q62376 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrnp70Q62376 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snrnp70Q62376 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrnp70Q62376 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrnp70Q62376 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrnp70Q62376 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snrnp70Q62376 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrnp70Q62376 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrnp70Q62376 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrnp70Q62376 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrnp70Q62376 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrnp70Q62376 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrnp70Q62376 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrnp70Q62376 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrnp70Q62376 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrnp70Q62376 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrnp70Q62376 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrnp70Q62376 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrnp70Q62376 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrnp70Q62376 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snrnp70Q62376 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snrnp70Q62376 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrnp70Q62376 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrnp70Q62376 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrnp70Q62376 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrnp70Q62376 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrnp70Q62376 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrnp70Q62376 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrnp70Q62376 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrnp70Q62376 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrnp70Q62376 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snrnp70Q62376 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snrnp70Q62376 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snrnp70Q62376 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snrnp70Q62376 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snrnp70Q62376 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snrnp70Q62376 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snrnp70Q62376 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snrnp70Q62376 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snrnp70Q62376 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Snrnp70Q62376 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snrnp70Q62376 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snrnp70Q62376 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snrnp70Q62376 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snrnp70Q62376 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snrnp70Q62376 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snrnp70Q62376 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snrnp70Q62376 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snrnp70Q62376 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms