Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Six3Q62233 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Six3Q62233 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Six3Q62233 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Six3Q62233 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Six3Q62233 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Six3Q62233 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Six3Q62233 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Six3Q62233 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Six3Q62233 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Six3Q62233 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Six3Q62233 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Six3Q62233 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Six3Q62233 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Six3Q62233 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Six3Q62233 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Six3Q62233 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Six3Q62233 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Six3Q62233 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Six3Q62233 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Six3Q62233 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Six3Q62233 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Six3Q62233 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Six3Q62233 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Six3Q62233 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Six3Q62233 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Six3Q62233 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Six3Q62233 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Six3Q62233 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Six3Q62233 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Six3Q62233 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Six3Q62233 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Six3Q62233 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Six3Q62233 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Six3Q62233 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Six3Q62233 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Six3Q62233 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Six3Q62233 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Six3Q62233 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Six3Q62233 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Six3Q62233 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Six3Q62233 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Six3Q62233 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Six3Q62233 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Six3Q62233 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Six3Q62233 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Six3Q62233 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Six3Q62233 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Six3Q62233 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Six3Q62233 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Six3Q62233 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Six3Q62233 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Six3Q62233 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Six3Q62233 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Six3Q62233 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Six3Q62233 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Six3Q62233 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Six3Q62233 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Six3Q62233 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Six3Q62233 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Six3Q62233 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Six3Q62233 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Six3Q62233 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Six3Q62233 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Six3Q62233 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Six3Q62233 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Six3Q62233 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Six3Q62233 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Six3Q62233 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Six3Q62233 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Six3Q62233 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Six3Q62233 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Six3Q62233 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Six3Q62233 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Six3Q62233 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Six3Q62233 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Six3Q62233 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Six3Q62233 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Six3Q62233 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Six3Q62233 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Six3Q62233 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Six3Q62233 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Six3Q62233 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Six3Q62233 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Six3Q62233 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Six3Q62233 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Six3Q62233 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Six3Q62233 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Six3Q62233 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Six3Q62233 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Six3Q62233 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Six3Q62233 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Six3Q62233 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Six3Q62233 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Six3Q62233 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Six3Q62233 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Six3Q62233 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Six3Q62233 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Six3Q62233 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Six3Q62233 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms