Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Scn9aQ62205 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC31,35■■■□□ 2,61
Scn9aQ62205 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Scn9aQ62205 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Scn9aQ62205 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC31,32■■■□□ 2,6
Scn9aQ62205 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Scn9aQ62205 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,3■■■□□ 2,6
Scn9aQ62205 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Scn9aQ62205 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Scn9aQ62205 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31,28■■■□□ 2,6
Scn9aQ62205 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,27■■■□□ 2,6
Scn9aQ62205 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC31,25■■■□□ 2,59
Scn9aQ62205 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Scn9aQ62205 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Scn9aQ62205 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,2■■■□□ 2,58
Scn9aQ62205 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Scn9aQ62205 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Scn9aQ62205 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Scn9aQ62205 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,17■■■□□ 2,58
Scn9aQ62205 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Scn9aQ62205 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Scn9aQ62205 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Scn9aQ62205 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Scn9aQ62205 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,14■■■□□ 2,58
Scn9aQ62205 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Scn9aQ62205 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Scn9aQ62205 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Scn9aQ62205 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC31,12■■■□□ 2,57
Scn9aQ62205 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Scn9aQ62205 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,11■■■□□ 2,57
Scn9aQ62205 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Scn9aQ62205 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Scn9aQ62205 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Scn9aQ62205 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Scn9aQ62205 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Scn9aQ62205 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,06■■■□□ 2,56
Scn9aQ62205 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Scn9aQ62205 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Scn9aQ62205 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Scn9aQ62205 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC31,02■■■□□ 2,56
Scn9aQ62205 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Scn9aQ62205 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Scn9aQ62205 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,97■■■□□ 2,55
Scn9aQ62205 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC30,97■■■□□ 2,55
Scn9aQ62205 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Scn9aQ62205 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Scn9aQ62205 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30,96■■■□□ 2,55
Scn9aQ62205 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,96■■■□□ 2,55
Scn9aQ62205 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Scn9aQ62205 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,93■■■□□ 2,54
Scn9aQ62205 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Scn9aQ62205 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC30,92■■■□□ 2,54
Scn9aQ62205 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30,91■■■□□ 2,54
Scn9aQ62205 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Scn9aQ62205 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Scn9aQ62205 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Scn9aQ62205 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Scn9aQ62205 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Scn9aQ62205 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Scn9aQ62205 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Scn9aQ62205 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,82■■■□□ 2,53
Scn9aQ62205 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Scn9aQ62205 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Scn9aQ62205 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,79■■■□□ 2,52
Scn9aQ62205 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30,77■■■□□ 2,52
Scn9aQ62205 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30,75■■■□□ 2,51
Scn9aQ62205 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Scn9aQ62205 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Scn9aQ62205 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30,74■■■□□ 2,51
Scn9aQ62205 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Scn9aQ62205 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Scn9aQ62205 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Scn9aQ62205 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Scn9aQ62205 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30,67■■■□□ 2,5
Scn9aQ62205 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC30,67■■■□□ 2,5
Scn9aQ62205 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Scn9aQ62205 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Scn9aQ62205 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Scn9aQ62205 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Scn9aQ62205 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30,63■■■□□ 2,49
Scn9aQ62205 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Scn9aQ62205 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Scn9aQ62205 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Scn9aQ62205 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30,61■■■□□ 2,49
Scn9aQ62205 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30,6■■■□□ 2,49
Scn9aQ62205 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Scn9aQ62205 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30,6■■■□□ 2,49
Scn9aQ62205 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Scn9aQ62205 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Scn9aQ62205 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Scn9aQ62205 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30,58■■■□□ 2,49
Scn9aQ62205 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Scn9aQ62205 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Scn9aQ62205 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Scn9aQ62205 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Scn9aQ62205 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Scn9aQ62205 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Scn9aQ62205 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30,55■■■□□ 2,48
Scn9aQ62205 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Scn9aQ62205 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms