Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RhocQ62159 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RhocQ62159 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RhocQ62159 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RhocQ62159 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RhocQ62159 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RhocQ62159 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RhocQ62159 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RhocQ62159 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RhocQ62159 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RhocQ62159 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RhocQ62159 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RhocQ62159 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RhocQ62159 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RhocQ62159 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RhocQ62159 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RhocQ62159 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RhocQ62159 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RhocQ62159 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RhocQ62159 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RhocQ62159 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RhocQ62159 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RhocQ62159 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RhocQ62159 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RhocQ62159 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RhocQ62159 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RhocQ62159 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RhocQ62159 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RhocQ62159 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RhocQ62159 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RhocQ62159 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RhocQ62159 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RhocQ62159 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RhocQ62159 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RhocQ62159 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RhocQ62159 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RhocQ62159 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RhocQ62159 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RhocQ62159 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RhocQ62159 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RhocQ62159 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RhocQ62159 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RhocQ62159 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RhocQ62159 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RhocQ62159 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RhocQ62159 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RhocQ62159 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RhocQ62159 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RhocQ62159 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RhocQ62159 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RhocQ62159 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RhocQ62159 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RhocQ62159 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RhocQ62159 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RhocQ62159 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RhocQ62159 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RhocQ62159 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RhocQ62159 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RhocQ62159 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RhocQ62159 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RhocQ62159 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RhocQ62159 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RhocQ62159 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RhocQ62159 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RhocQ62159 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RhocQ62159 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RhocQ62159 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RhocQ62159 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RhocQ62159 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RhocQ62159 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RhocQ62159 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RhocQ62159 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RhocQ62159 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RhocQ62159 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RhocQ62159 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RhocQ62159 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RhocQ62159 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RhocQ62159 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RhocQ62159 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RhocQ62159 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RhocQ62159 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RhocQ62159 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RhocQ62159 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RhocQ62159 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RhocQ62159 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RhocQ62159 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RhocQ62159 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RhocQ62159 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RhocQ62159 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RhocQ62159 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RhocQ62159 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RhocQ62159 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RhocQ62159 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RhocQ62159 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RhocQ62159 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RhocQ62159 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RhocQ62159 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RhocQ62159 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RhocQ62159 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RhocQ62159 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms