Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prm3Q62100 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prm3Q62100 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prm3Q62100 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prm3Q62100 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prm3Q62100 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prm3Q62100 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prm3Q62100 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prm3Q62100 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prm3Q62100 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prm3Q62100 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prm3Q62100 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prm3Q62100 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prm3Q62100 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prm3Q62100 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prm3Q62100 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prm3Q62100 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Prm3Q62100 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prm3Q62100 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prm3Q62100 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prm3Q62100 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Prm3Q62100 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Prm3Q62100 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Prm3Q62100 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prm3Q62100 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prm3Q62100 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prm3Q62100 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prm3Q62100 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prm3Q62100 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Prm3Q62100 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prm3Q62100 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prm3Q62100 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prm3Q62100 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prm3Q62100 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prm3Q62100 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prm3Q62100 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prm3Q62100 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Prm3Q62100 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prm3Q62100 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prm3Q62100 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Prm3Q62100 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prm3Q62100 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prm3Q62100 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prm3Q62100 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Prm3Q62100 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Prm3Q62100 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prm3Q62100 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prm3Q62100 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prm3Q62100 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Prm3Q62100 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prm3Q62100 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prm3Q62100 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Prm3Q62100 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prm3Q62100 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prm3Q62100 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Prm3Q62100 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prm3Q62100 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prm3Q62100 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prm3Q62100 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prm3Q62100 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prm3Q62100 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prm3Q62100 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prm3Q62100 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prm3Q62100 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prm3Q62100 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prm3Q62100 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Prm3Q62100 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prm3Q62100 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prm3Q62100 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prm3Q62100 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prm3Q62100 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prm3Q62100 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prm3Q62100 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prm3Q62100 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prm3Q62100 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prm3Q62100 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prm3Q62100 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Prm3Q62100 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prm3Q62100 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prm3Q62100 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prm3Q62100 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prm3Q62100 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prm3Q62100 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prm3Q62100 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prm3Q62100 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prm3Q62100 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prm3Q62100 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prm3Q62100 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Prm3Q62100 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Prm3Q62100 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prm3Q62100 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Prm3Q62100 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prm3Q62100 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prm3Q62100 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prm3Q62100 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prm3Q62100 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Prm3Q62100 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prm3Q62100 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prm3Q62100 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prm3Q62100 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms