Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrn1Q61809 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrn1Q61809 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrn1Q61809 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrn1Q61809 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrn1Q61809 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrn1Q61809 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrn1Q61809 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrn1Q61809 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrn1Q61809 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrn1Q61809 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrn1Q61809 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrn1Q61809 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrn1Q61809 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrn1Q61809 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrn1Q61809 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrn1Q61809 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrn1Q61809 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrn1Q61809 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrn1Q61809 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrn1Q61809 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn1Q61809 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn1Q61809 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn1Q61809 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn1Q61809 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrn1Q61809 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrn1Q61809 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrn1Q61809 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrn1Q61809 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrn1Q61809 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrn1Q61809 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrn1Q61809 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrn1Q61809 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrn1Q61809 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrn1Q61809 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrn1Q61809 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrn1Q61809 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrn1Q61809 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrn1Q61809 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrn1Q61809 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrn1Q61809 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrn1Q61809 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrn1Q61809 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrn1Q61809 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrn1Q61809 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrn1Q61809 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrn1Q61809 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrn1Q61809 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrn1Q61809 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrn1Q61809 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrn1Q61809 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrn1Q61809 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrn1Q61809 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrn1Q61809 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrn1Q61809 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrn1Q61809 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrn1Q61809 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrn1Q61809 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrn1Q61809 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrn1Q61809 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrn1Q61809 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn1Q61809 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn1Q61809 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn1Q61809 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn1Q61809 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrn1Q61809 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrn1Q61809 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrn1Q61809 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrn1Q61809 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrn1Q61809 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn1Q61809 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn1Q61809 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn1Q61809 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrn1Q61809 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrn1Q61809 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrn1Q61809 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrn1Q61809 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrn1Q61809 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrn1Q61809 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrn1Q61809 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrn1Q61809 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrn1Q61809 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrn1Q61809 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrn1Q61809 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrn1Q61809 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrn1Q61809 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrn1Q61809 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrn1Q61809 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrn1Q61809 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrn1Q61809 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrn1Q61809 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrn1Q61809 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrn1Q61809 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrn1Q61809 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrn1Q61809 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrn1Q61809 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrn1Q61809 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrn1Q61809 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrn1Q61809 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrn1Q61809 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms