Protein–RNA interactions for Protein: Q61771

Kif3b, Kinesin-like protein KIF3B, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3bQ61771 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,06■■■■□ 3,68
Kif3bQ61771 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,05■■■■□ 3,68
Kif3bQ61771 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC38,04■■■■□ 3,68
Kif3bQ61771 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,03■■■■□ 3,68
Kif3bQ61771 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,03■■■■□ 3,68
Kif3bQ61771 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38,03■■■■□ 3,68
Kif3bQ61771 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC38■■■■□ 3,67
Kif3bQ61771 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3,67
Kif3bQ61771 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,99■■■■□ 3,67
Kif3bQ61771 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC37,96■■■■□ 3,67
Kif3bQ61771 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,95■■■■□ 3,67
Kif3bQ61771 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC37,94■■■■□ 3,66
Kif3bQ61771 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC37,92■■■■□ 3,66
Kif3bQ61771 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC37,9■■■■□ 3,66
Kif3bQ61771 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37,9■■■■□ 3,66
Kif3bQ61771 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC37,9■■■■□ 3,66
Kif3bQ61771 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC37,89■■■■□ 3,66
Kif3bQ61771 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC37,88■■■■□ 3,65
Kif3bQ61771 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,87■■■■□ 3,65
Kif3bQ61771 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,87■■■■□ 3,65
Kif3bQ61771 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC37,86■■■■□ 3,65
Kif3bQ61771 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37,85■■■■□ 3,65
Kif3bQ61771 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC37,84■■■■□ 3,65
Kif3bQ61771 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC37,83■■■■□ 3,65
Kif3bQ61771 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,8■■■■□ 3,64
Kif3bQ61771 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC37,8■■■■□ 3,64
Kif3bQ61771 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,8■■■■□ 3,64
Kif3bQ61771 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,79■■■■□ 3,64
Kif3bQ61771 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,78■■■■□ 3,64
Kif3bQ61771 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,77■■■■□ 3,64
Kif3bQ61771 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC37,76■■■■□ 3,64
Kif3bQ61771 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,75■■■■□ 3,63
Kif3bQ61771 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,75■■■■□ 3,63
Kif3bQ61771 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,75■■■■□ 3,63
Kif3bQ61771 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC37,74■■■■□ 3,63
Kif3bQ61771 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
Kif3bQ61771 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
Kif3bQ61771 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,71■■■■□ 3,63
Kif3bQ61771 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,71■■■■□ 3,63
Kif3bQ61771 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC37,7■■■■□ 3,63
Kif3bQ61771 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,69■■■■□ 3,62
Kif3bQ61771 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,68■■■■□ 3,62
Kif3bQ61771 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37,68■■■■□ 3,62
Kif3bQ61771 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC37,66■■■■□ 3,62
Kif3bQ61771 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,61■■■■□ 3,61
Kif3bQ61771 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,61■■■■□ 3,61
Kif3bQ61771 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC37,6■■■■□ 3,61
Kif3bQ61771 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC37,6■■■■□ 3,61
Kif3bQ61771 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,6■■■■□ 3,61
Kif3bQ61771 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC37,57■■■■□ 3,6
Kif3bQ61771 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC37,55■■■■□ 3,6
Kif3bQ61771 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC37,55■■■■□ 3,6
Kif3bQ61771 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC37,55■■■■□ 3,6
Kif3bQ61771 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,55■■■■□ 3,6
Kif3bQ61771 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
Kif3bQ61771 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,51■■■■□ 3,6
Kif3bQ61771 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,5■■■■□ 3,59
Kif3bQ61771 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,5■■■■□ 3,59
Kif3bQ61771 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC37,48■■■■□ 3,59
Kif3bQ61771 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Kif3bQ61771 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,46■■■■□ 3,59
Kif3bQ61771 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC37,46■■■■□ 3,59
Kif3bQ61771 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
Kif3bQ61771 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC37,46■■■■□ 3,59
Kif3bQ61771 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
Kif3bQ61771 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,44■■■■□ 3,58
Kif3bQ61771 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,43■■■■□ 3,58
Kif3bQ61771 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC37,43■■■■□ 3,58
Kif3bQ61771 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC37,42■■■■□ 3,58
Kif3bQ61771 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC37,41■■■■□ 3,58
Kif3bQ61771 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37,41■■■■□ 3,58
Kif3bQ61771 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37,41■■■■□ 3,58
Kif3bQ61771 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,41■■■■□ 3,58
Kif3bQ61771 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,41■■■■□ 3,58
Kif3bQ61771 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,38■■■■□ 3,58
Kif3bQ61771 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,33■■■■□ 3,57
Kif3bQ61771 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC37,31■■■■□ 3,56
Kif3bQ61771 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,31■■■■□ 3,56
Kif3bQ61771 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,3■■■■□ 3,56
Kif3bQ61771 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC37,3■■■■□ 3,56
Kif3bQ61771 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC37,26■■■■□ 3,56
Kif3bQ61771 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC37,25■■■■□ 3,55
Kif3bQ61771 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC37,24■■■■□ 3,55
Kif3bQ61771 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37,24■■■■□ 3,55
Kif3bQ61771 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,23■■■■□ 3,55
Kif3bQ61771 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37,23■■■■□ 3,55
Kif3bQ61771 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,22■■■■□ 3,55
Kif3bQ61771 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
Kif3bQ61771 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
Kif3bQ61771 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,21■■■■□ 3,55
Kif3bQ61771 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC37,21■■■■□ 3,55
Kif3bQ61771 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,2■■■■□ 3,55
Kif3bQ61771 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,19■■■■□ 3,54
Kif3bQ61771 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC37,18■■■■□ 3,54
Kif3bQ61771 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC37,17■■■■□ 3,54
Kif3bQ61771 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Kif3bQ61771 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Kif3bQ61771 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Kif3bQ61771 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,16■■■■□ 3,54
Kif3bQ61771 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,16■■■■□ 3,54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,5 ms