Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AtrxQ61687 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AtrxQ61687 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
AtrxQ61687 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AtrxQ61687 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AtrxQ61687 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AtrxQ61687 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AtrxQ61687 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AtrxQ61687 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AtrxQ61687 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AtrxQ61687 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AtrxQ61687 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AtrxQ61687 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AtrxQ61687 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AtrxQ61687 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AtrxQ61687 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AtrxQ61687 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AtrxQ61687 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AtrxQ61687 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AtrxQ61687 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AtrxQ61687 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AtrxQ61687 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AtrxQ61687 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AtrxQ61687 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AtrxQ61687 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AtrxQ61687 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AtrxQ61687 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AtrxQ61687 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AtrxQ61687 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AtrxQ61687 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AtrxQ61687 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AtrxQ61687 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AtrxQ61687 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AtrxQ61687 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AtrxQ61687 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AtrxQ61687 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AtrxQ61687 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AtrxQ61687 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AtrxQ61687 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AtrxQ61687 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AtrxQ61687 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AtrxQ61687 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AtrxQ61687 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AtrxQ61687 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AtrxQ61687 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AtrxQ61687 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AtrxQ61687 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AtrxQ61687 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AtrxQ61687 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AtrxQ61687 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AtrxQ61687 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AtrxQ61687 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AtrxQ61687 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AtrxQ61687 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AtrxQ61687 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AtrxQ61687 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AtrxQ61687 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AtrxQ61687 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AtrxQ61687 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AtrxQ61687 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AtrxQ61687 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AtrxQ61687 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AtrxQ61687 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AtrxQ61687 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AtrxQ61687 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AtrxQ61687 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AtrxQ61687 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AtrxQ61687 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AtrxQ61687 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AtrxQ61687 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AtrxQ61687 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AtrxQ61687 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AtrxQ61687 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AtrxQ61687 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AtrxQ61687 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AtrxQ61687 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AtrxQ61687 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AtrxQ61687 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AtrxQ61687 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AtrxQ61687 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AtrxQ61687 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AtrxQ61687 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AtrxQ61687 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AtrxQ61687 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AtrxQ61687 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AtrxQ61687 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AtrxQ61687 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AtrxQ61687 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AtrxQ61687 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AtrxQ61687 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AtrxQ61687 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AtrxQ61687 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AtrxQ61687 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AtrxQ61687 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AtrxQ61687 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AtrxQ61687 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
AtrxQ61687 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AtrxQ61687 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AtrxQ61687 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AtrxQ61687 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.9 ms