Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ifi47Q61635 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ifi47Q61635 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ifi47Q61635 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ifi47Q61635 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ifi47Q61635 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ifi47Q61635 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ifi47Q61635 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ifi47Q61635 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ifi47Q61635 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ifi47Q61635 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ifi47Q61635 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ifi47Q61635 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ifi47Q61635 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ifi47Q61635 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ifi47Q61635 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ifi47Q61635 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ifi47Q61635 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ifi47Q61635 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ifi47Q61635 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ifi47Q61635 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ifi47Q61635 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ifi47Q61635 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifi47Q61635 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ifi47Q61635 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ifi47Q61635 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ifi47Q61635 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ifi47Q61635 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ifi47Q61635 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ifi47Q61635 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ifi47Q61635 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ifi47Q61635 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ifi47Q61635 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ifi47Q61635 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ifi47Q61635 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ifi47Q61635 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ifi47Q61635 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ifi47Q61635 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ifi47Q61635 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ifi47Q61635 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ifi47Q61635 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifi47Q61635 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifi47Q61635 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifi47Q61635 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ifi47Q61635 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifi47Q61635 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifi47Q61635 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifi47Q61635 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifi47Q61635 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifi47Q61635 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifi47Q61635 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifi47Q61635 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifi47Q61635 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ifi47Q61635 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifi47Q61635 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifi47Q61635 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifi47Q61635 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifi47Q61635 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifi47Q61635 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifi47Q61635 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifi47Q61635 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifi47Q61635 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifi47Q61635 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifi47Q61635 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifi47Q61635 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ifi47Q61635 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifi47Q61635 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifi47Q61635 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifi47Q61635 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifi47Q61635 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifi47Q61635 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifi47Q61635 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifi47Q61635 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifi47Q61635 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifi47Q61635 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifi47Q61635 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifi47Q61635 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifi47Q61635 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifi47Q61635 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifi47Q61635 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifi47Q61635 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifi47Q61635 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifi47Q61635 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifi47Q61635 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifi47Q61635 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifi47Q61635 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifi47Q61635 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ifi47Q61635 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifi47Q61635 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifi47Q61635 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifi47Q61635 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifi47Q61635 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifi47Q61635 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifi47Q61635 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ifi47Q61635 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifi47Q61635 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifi47Q61635 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifi47Q61635 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifi47Q61635 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifi47Q61635 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms