Protein–RNA interactions for Protein: Q61550

Rad21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad21Q61550 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rad21Q61550 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rad21Q61550 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rad21Q61550 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rad21Q61550 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rad21Q61550 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rad21Q61550 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rad21Q61550 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rad21Q61550 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rad21Q61550 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rad21Q61550 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rad21Q61550 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rad21Q61550 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rad21Q61550 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rad21Q61550 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rad21Q61550 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rad21Q61550 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rad21Q61550 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rad21Q61550 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rad21Q61550 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rad21Q61550 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rad21Q61550 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rad21Q61550 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rad21Q61550 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rad21Q61550 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rad21Q61550 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rad21Q61550 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rad21Q61550 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rad21Q61550 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rad21Q61550 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rad21Q61550 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rad21Q61550 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Rad21Q61550 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rad21Q61550 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rad21Q61550 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rad21Q61550 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rad21Q61550 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rad21Q61550 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Rad21Q61550 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Rad21Q61550 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Rad21Q61550 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rad21Q61550 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rad21Q61550 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rad21Q61550 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rad21Q61550 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rad21Q61550 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rad21Q61550 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rad21Q61550 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rad21Q61550 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Rad21Q61550 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rad21Q61550 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rad21Q61550 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rad21Q61550 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rad21Q61550 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rad21Q61550 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Rad21Q61550 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rad21Q61550 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rad21Q61550 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
Rad21Q61550 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Rad21Q61550 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Rad21Q61550 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rad21Q61550 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rad21Q61550 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rad21Q61550 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rad21Q61550 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rad21Q61550 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rad21Q61550 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rad21Q61550 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rad21Q61550 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Rad21Q61550 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rad21Q61550 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rad21Q61550 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rad21Q61550 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rad21Q61550 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rad21Q61550 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rad21Q61550 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rad21Q61550 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rad21Q61550 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rad21Q61550 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rad21Q61550 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rad21Q61550 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rad21Q61550 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rad21Q61550 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rad21Q61550 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rad21Q61550 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rad21Q61550 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rad21Q61550 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rad21Q61550 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Rad21Q61550 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Rad21Q61550 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rad21Q61550 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rad21Q61550 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rad21Q61550 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rad21Q61550 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rad21Q61550 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rad21Q61550 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rad21Q61550 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rad21Q61550 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rad21Q61550 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rad21Q61550 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms