Protein–RNA interactions for Protein: Q61549

Adgre1, Adhesion G protein-coupled receptor E1, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Adgre1Q61549 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Adgre1Q61549 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC31,55■■■□□ 2,64
Adgre1Q61549 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Adgre1Q61549 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC31,52■■■□□ 2,64
Adgre1Q61549 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC31,52■■■□□ 2,64
Adgre1Q61549 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Adgre1Q61549 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Adgre1Q61549 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Adgre1Q61549 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Adgre1Q61549 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Adgre1Q61549 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Adgre1Q61549 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Adgre1Q61549 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Adgre1Q61549 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Adgre1Q61549 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC31,46■■■□□ 2,63
Adgre1Q61549 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC31,45■■■□□ 2,63
Adgre1Q61549 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,44■■■□□ 2,62
Adgre1Q61549 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Adgre1Q61549 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Adgre1Q61549 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Adgre1Q61549 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC31,41■■■□□ 2,62
Adgre1Q61549 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC31,41■■■□□ 2,62
Adgre1Q61549 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Adgre1Q61549 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Adgre1Q61549 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Adgre1Q61549 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Adgre1Q61549 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Adgre1Q61549 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Adgre1Q61549 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31,36■■■□□ 2,61
Adgre1Q61549 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC31,36■■■□□ 2,61
Adgre1Q61549 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC31,35■■■□□ 2,61
Adgre1Q61549 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC31,35■■■□□ 2,61
Adgre1Q61549 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Adgre1Q61549 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,34■■■□□ 2,61
Adgre1Q61549 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Adgre1Q61549 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Adgre1Q61549 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC31,31■■■□□ 2,6
Adgre1Q61549 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Adgre1Q61549 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Adgre1Q61549 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,3■■■□□ 2,6
Adgre1Q61549 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC31,29■■■□□ 2,6
Adgre1Q61549 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC31,28■■■□□ 2,6
Adgre1Q61549 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Adgre1Q61549 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Adgre1Q61549 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Adgre1Q61549 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Adgre1Q61549 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Adgre1Q61549 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,21■■■□□ 2,59
Adgre1Q61549 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Adgre1Q61549 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Adgre1Q61549 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC31,19■■■□□ 2,58
Adgre1Q61549 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,17■■■□□ 2,58
Adgre1Q61549 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC31,16■■■□□ 2,58
Adgre1Q61549 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Adgre1Q61549 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,57
Adgre1Q61549 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Adgre1Q61549 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Adgre1Q61549 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC31,13■■■□□ 2,57
Adgre1Q61549 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Adgre1Q61549 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Adgre1Q61549 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Adgre1Q61549 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Adgre1Q61549 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Adgre1Q61549 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Adgre1Q61549 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC31,06■■■□□ 2,56
Adgre1Q61549 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Adgre1Q61549 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Adgre1Q61549 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Adgre1Q61549 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Adgre1Q61549 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Adgre1Q61549 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Adgre1Q61549 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Adgre1Q61549 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Adgre1Q61549 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Adgre1Q61549 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30,95■■■□□ 2,55
Adgre1Q61549 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30,95■■■□□ 2,55
Adgre1Q61549 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,95■■■□□ 2,55
Adgre1Q61549 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30,94■■■□□ 2,54
Adgre1Q61549 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30,9■■■□□ 2,54
Adgre1Q61549 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC30,9■■■□□ 2,54
Adgre1Q61549 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Adgre1Q61549 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,89■■■□□ 2,54
Adgre1Q61549 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Adgre1Q61549 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Adgre1Q61549 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Adgre1Q61549 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30,85■■■□□ 2,53
Adgre1Q61549 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Adgre1Q61549 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Adgre1Q61549 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Adgre1Q61549 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30,83■■■□□ 2,53
Adgre1Q61549 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC30,75■■■□□ 2,51
Adgre1Q61549 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Adgre1Q61549 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Adgre1Q61549 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Adgre1Q61549 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30,73■■■□□ 2,51
Adgre1Q61549 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Adgre1Q61549 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Adgre1Q61549 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Adgre1Q61549 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30,72■■■□□ 2,51
Adgre1Q61549 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30,7■■■□□ 2,51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms