Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
EsrrbQ61539 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EsrrbQ61539 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
EsrrbQ61539 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EsrrbQ61539 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EsrrbQ61539 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EsrrbQ61539 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EsrrbQ61539 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EsrrbQ61539 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EsrrbQ61539 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EsrrbQ61539 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EsrrbQ61539 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EsrrbQ61539 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EsrrbQ61539 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EsrrbQ61539 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EsrrbQ61539 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EsrrbQ61539 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EsrrbQ61539 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EsrrbQ61539 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
EsrrbQ61539 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EsrrbQ61539 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EsrrbQ61539 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EsrrbQ61539 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EsrrbQ61539 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EsrrbQ61539 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EsrrbQ61539 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EsrrbQ61539 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EsrrbQ61539 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EsrrbQ61539 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EsrrbQ61539 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EsrrbQ61539 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EsrrbQ61539 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EsrrbQ61539 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EsrrbQ61539 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EsrrbQ61539 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EsrrbQ61539 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EsrrbQ61539 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EsrrbQ61539 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EsrrbQ61539 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EsrrbQ61539 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EsrrbQ61539 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
EsrrbQ61539 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EsrrbQ61539 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EsrrbQ61539 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EsrrbQ61539 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EsrrbQ61539 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EsrrbQ61539 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EsrrbQ61539 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EsrrbQ61539 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
EsrrbQ61539 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EsrrbQ61539 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EsrrbQ61539 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EsrrbQ61539 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EsrrbQ61539 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EsrrbQ61539 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EsrrbQ61539 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EsrrbQ61539 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EsrrbQ61539 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EsrrbQ61539 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EsrrbQ61539 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EsrrbQ61539 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EsrrbQ61539 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EsrrbQ61539 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EsrrbQ61539 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
EsrrbQ61539 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EsrrbQ61539 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EsrrbQ61539 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EsrrbQ61539 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EsrrbQ61539 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EsrrbQ61539 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EsrrbQ61539 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EsrrbQ61539 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EsrrbQ61539 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EsrrbQ61539 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EsrrbQ61539 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EsrrbQ61539 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EsrrbQ61539 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EsrrbQ61539 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EsrrbQ61539 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EsrrbQ61539 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EsrrbQ61539 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EsrrbQ61539 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EsrrbQ61539 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EsrrbQ61539 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EsrrbQ61539 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EsrrbQ61539 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EsrrbQ61539 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EsrrbQ61539 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EsrrbQ61539 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EsrrbQ61539 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EsrrbQ61539 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EsrrbQ61539 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EsrrbQ61539 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EsrrbQ61539 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EsrrbQ61539 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EsrrbQ61539 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EsrrbQ61539 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
EsrrbQ61539 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EsrrbQ61539 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EsrrbQ61539 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms