Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox17Q61473 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox17Q61473 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox17Q61473 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox17Q61473 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox17Q61473 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox17Q61473 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox17Q61473 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox17Q61473 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox17Q61473 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox17Q61473 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox17Q61473 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox17Q61473 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox17Q61473 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox17Q61473 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sox17Q61473 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox17Q61473 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox17Q61473 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox17Q61473 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox17Q61473 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox17Q61473 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox17Q61473 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox17Q61473 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox17Q61473 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox17Q61473 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox17Q61473 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox17Q61473 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox17Q61473 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox17Q61473 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox17Q61473 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox17Q61473 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox17Q61473 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox17Q61473 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox17Q61473 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox17Q61473 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox17Q61473 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox17Q61473 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox17Q61473 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox17Q61473 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox17Q61473 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox17Q61473 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox17Q61473 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox17Q61473 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox17Q61473 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox17Q61473 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox17Q61473 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox17Q61473 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox17Q61473 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox17Q61473 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox17Q61473 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox17Q61473 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox17Q61473 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox17Q61473 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox17Q61473 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox17Q61473 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox17Q61473 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox17Q61473 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox17Q61473 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox17Q61473 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sox17Q61473 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox17Q61473 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox17Q61473 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox17Q61473 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox17Q61473 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox17Q61473 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox17Q61473 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox17Q61473 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox17Q61473 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox17Q61473 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox17Q61473 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox17Q61473 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox17Q61473 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox17Q61473 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox17Q61473 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox17Q61473 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox17Q61473 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox17Q61473 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sox17Q61473 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox17Q61473 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox17Q61473 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox17Q61473 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox17Q61473 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox17Q61473 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox17Q61473 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox17Q61473 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox17Q61473 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox17Q61473 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox17Q61473 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox17Q61473 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox17Q61473 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox17Q61473 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox17Q61473 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox17Q61473 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox17Q61473 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox17Q61473 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox17Q61473 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox17Q61473 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox17Q61473 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox17Q61473 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox17Q61473 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms