Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Ccne1Q61457 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34,11■■■■□ 3,05
Ccne1Q61457 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Ccne1Q61457 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34,09■■■■□ 3,05
Ccne1Q61457 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC34,09■■■■□ 3,05
Ccne1Q61457 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,09■■■■□ 3,05
Ccne1Q61457 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Ccne1Q61457 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC34,08■■■■□ 3,05
Ccne1Q61457 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Ccne1Q61457 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Ccne1Q61457 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Ccne1Q61457 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Ccne1Q61457 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC34,04■■■■□ 3,04
Ccne1Q61457 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Ccne1Q61457 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,02■■■■□ 3,04
Ccne1Q61457 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Ccne1Q61457 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Ccne1Q61457 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Ccne1Q61457 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC33,98■■■■□ 3,03
Ccne1Q61457 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Ccne1Q61457 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,96■■■■□ 3,03
Ccne1Q61457 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Ccne1Q61457 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Ccne1Q61457 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Ccne1Q61457 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Ccne1Q61457 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Ccne1Q61457 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Ccne1Q61457 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Ccne1Q61457 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC33,84■■■■□ 3,01
Ccne1Q61457 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Ccne1Q61457 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3,01
Ccne1Q61457 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Ccne1Q61457 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Ccne1Q61457 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Ccne1Q61457 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33,77■■■■□ 3
Ccne1Q61457 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC33,77■■■■□ 3
Ccne1Q61457 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33,76■■■■□ 3
Ccne1Q61457 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC33,75■■■□□ 2,99
Ccne1Q61457 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33,74■■■□□ 2,99
Ccne1Q61457 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Ccne1Q61457 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Ccne1Q61457 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Ccne1Q61457 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Ccne1Q61457 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC33,72■■■□□ 2,99
Ccne1Q61457 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Ccne1Q61457 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Ccne1Q61457 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Ccne1Q61457 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Ccne1Q61457 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Ccne1Q61457 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,68■■■□□ 2,98
Ccne1Q61457 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Ccne1Q61457 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC33,67■■■□□ 2,98
Ccne1Q61457 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Ccne1Q61457 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33,67■■■□□ 2,98
Ccne1Q61457 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Ccne1Q61457 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC33,65■■■□□ 2,98
Ccne1Q61457 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Ccne1Q61457 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Ccne1Q61457 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Ccne1Q61457 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC33,61■■■□□ 2,97
Ccne1Q61457 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Ccne1Q61457 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Ccne1Q61457 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Ccne1Q61457 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33,56■■■□□ 2,96
Ccne1Q61457 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Ccne1Q61457 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Ccne1Q61457 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Ccne1Q61457 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC33,55■■■□□ 2,96
Ccne1Q61457 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Ccne1Q61457 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Ccne1Q61457 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Ccne1Q61457 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Ccne1Q61457 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC33,52■■■□□ 2,96
Ccne1Q61457 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33,5■■■□□ 2,95
Ccne1Q61457 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC33,5■■■□□ 2,95
Ccne1Q61457 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Ccne1Q61457 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Ccne1Q61457 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC33,47■■■□□ 2,95
Ccne1Q61457 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,47■■■□□ 2,95
Ccne1Q61457 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33,46■■■□□ 2,95
Ccne1Q61457 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,45■■■□□ 2,95
Ccne1Q61457 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Ccne1Q61457 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC33,42■■■□□ 2,94
Ccne1Q61457 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Ccne1Q61457 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,42■■■□□ 2,94
Ccne1Q61457 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC33,41■■■□□ 2,94
Ccne1Q61457 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Ccne1Q61457 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33,39■■■□□ 2,94
Ccne1Q61457 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Ccne1Q61457 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC33,39■■■□□ 2,94
Ccne1Q61457 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,38■■■□□ 2,93
Ccne1Q61457 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Ccne1Q61457 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Ccne1Q61457 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Ccne1Q61457 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Ccne1Q61457 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Ccne1Q61457 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Ccne1Q61457 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Ccne1Q61457 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Ccne1Q61457 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33,26■■■□□ 2,92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,7 ms