Protein–RNA interactions for Protein: Q61425

Hadh, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HadhQ61425 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HadhQ61425 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HadhQ61425 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HadhQ61425 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HadhQ61425 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HadhQ61425 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HadhQ61425 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HadhQ61425 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HadhQ61425 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HadhQ61425 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HadhQ61425 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HadhQ61425 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HadhQ61425 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HadhQ61425 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HadhQ61425 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HadhQ61425 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HadhQ61425 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HadhQ61425 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HadhQ61425 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HadhQ61425 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HadhQ61425 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HadhQ61425 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HadhQ61425 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HadhQ61425 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HadhQ61425 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HadhQ61425 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HadhQ61425 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HadhQ61425 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HadhQ61425 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HadhQ61425 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HadhQ61425 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HadhQ61425 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HadhQ61425 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HadhQ61425 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HadhQ61425 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HadhQ61425 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HadhQ61425 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HadhQ61425 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HadhQ61425 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HadhQ61425 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HadhQ61425 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HadhQ61425 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HadhQ61425 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HadhQ61425 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HadhQ61425 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HadhQ61425 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HadhQ61425 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HadhQ61425 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HadhQ61425 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HadhQ61425 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HadhQ61425 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HadhQ61425 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HadhQ61425 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HadhQ61425 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HadhQ61425 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HadhQ61425 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HadhQ61425 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HadhQ61425 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HadhQ61425 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HadhQ61425 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HadhQ61425 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HadhQ61425 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HadhQ61425 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HadhQ61425 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HadhQ61425 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HadhQ61425 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HadhQ61425 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HadhQ61425 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HadhQ61425 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HadhQ61425 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HadhQ61425 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HadhQ61425 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HadhQ61425 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HadhQ61425 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HadhQ61425 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HadhQ61425 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HadhQ61425 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HadhQ61425 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HadhQ61425 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HadhQ61425 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HadhQ61425 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HadhQ61425 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HadhQ61425 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HadhQ61425 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HadhQ61425 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HadhQ61425 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HadhQ61425 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HadhQ61425 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HadhQ61425 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HadhQ61425 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HadhQ61425 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HadhQ61425 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HadhQ61425 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HadhQ61425 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HadhQ61425 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HadhQ61425 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HadhQ61425 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HadhQ61425 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HadhQ61425 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HadhQ61425 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms