Protein–RNA interactions for Protein: Q61169

Gata6, Transcription factor GATA-6, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata6Q61169 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gata6Q61169 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gata6Q61169 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gata6Q61169 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gata6Q61169 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gata6Q61169 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gata6Q61169 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gata6Q61169 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gata6Q61169 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gata6Q61169 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gata6Q61169 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gata6Q61169 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gata6Q61169 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gata6Q61169 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gata6Q61169 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gata6Q61169 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gata6Q61169 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gata6Q61169 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gata6Q61169 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gata6Q61169 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gata6Q61169 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gata6Q61169 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gata6Q61169 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gata6Q61169 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gata6Q61169 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gata6Q61169 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gata6Q61169 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gata6Q61169 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gata6Q61169 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gata6Q61169 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gata6Q61169 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gata6Q61169 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gata6Q61169 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gata6Q61169 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gata6Q61169 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gata6Q61169 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gata6Q61169 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gata6Q61169 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gata6Q61169 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gata6Q61169 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gata6Q61169 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gata6Q61169 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gata6Q61169 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gata6Q61169 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gata6Q61169 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gata6Q61169 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gata6Q61169 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gata6Q61169 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gata6Q61169 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gata6Q61169 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gata6Q61169 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gata6Q61169 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gata6Q61169 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gata6Q61169 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gata6Q61169 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gata6Q61169 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gata6Q61169 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gata6Q61169 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gata6Q61169 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gata6Q61169 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gata6Q61169 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gata6Q61169 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gata6Q61169 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gata6Q61169 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gata6Q61169 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gata6Q61169 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gata6Q61169 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gata6Q61169 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gata6Q61169 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gata6Q61169 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gata6Q61169 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gata6Q61169 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gata6Q61169 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gata6Q61169 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gata6Q61169 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gata6Q61169 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gata6Q61169 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gata6Q61169 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gata6Q61169 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gata6Q61169 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gata6Q61169 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gata6Q61169 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gata6Q61169 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gata6Q61169 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gata6Q61169 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gata6Q61169 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gata6Q61169 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gata6Q61169 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gata6Q61169 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gata6Q61169 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gata6Q61169 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gata6Q61169 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gata6Q61169 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gata6Q61169 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gata6Q61169 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gata6Q61169 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gata6Q61169 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gata6Q61169 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gata6Q61169 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gata6Q61169 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.2 ms