Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,91■■■□□ 2,54
NinQ61043 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
NinQ61043 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
NinQ61043 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30,86■■■□□ 2,53
NinQ61043 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
NinQ61043 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30,85■■■□□ 2,53
NinQ61043 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC30,85■■■□□ 2,53
NinQ61043 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,84■■■□□ 2,53
NinQ61043 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,84■■■□□ 2,53
NinQ61043 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
NinQ61043 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
NinQ61043 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
NinQ61043 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
NinQ61043 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,81■■■□□ 2,52
NinQ61043 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
NinQ61043 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30,8■■■□□ 2,52
NinQ61043 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
NinQ61043 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
NinQ61043 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
NinQ61043 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
NinQ61043 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
NinQ61043 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
NinQ61043 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,76■■■□□ 2,52
NinQ61043 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30,76■■■□□ 2,51
NinQ61043 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
NinQ61043 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,72■■■□□ 2,51
NinQ61043 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30,72■■■□□ 2,51
NinQ61043 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
NinQ61043 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
NinQ61043 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
NinQ61043 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC30,63■■■□□ 2,49
NinQ61043 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,62■■■□□ 2,49
NinQ61043 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
NinQ61043 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
NinQ61043 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
NinQ61043 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
NinQ61043 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
NinQ61043 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
NinQ61043 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,56■■■□□ 2,48
NinQ61043 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,56■■■□□ 2,48
NinQ61043 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
NinQ61043 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
NinQ61043 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,52■■■□□ 2,48
NinQ61043 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
NinQ61043 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC30,51■■■□□ 2,47
NinQ61043 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,49■■■□□ 2,47
NinQ61043 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30,47■■■□□ 2,47
NinQ61043 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30,46■■■□□ 2,47
NinQ61043 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30,42■■■□□ 2,46
NinQ61043 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
NinQ61043 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30,41■■■□□ 2,46
NinQ61043 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
NinQ61043 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
NinQ61043 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30,39■■■□□ 2,46
NinQ61043 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
NinQ61043 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
NinQ61043 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
NinQ61043 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30,38■■■□□ 2,45
NinQ61043 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
NinQ61043 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
NinQ61043 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
NinQ61043 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30,35■■■□□ 2,45
NinQ61043 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,35■■■□□ 2,45
NinQ61043 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
NinQ61043 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,33■■■□□ 2,45
NinQ61043 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
NinQ61043 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30,31■■■□□ 2,44
NinQ61043 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
NinQ61043 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
NinQ61043 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
NinQ61043 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
NinQ61043 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30,27■■■□□ 2,44
NinQ61043 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30,27■■■□□ 2,44
NinQ61043 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30,27■■■□□ 2,44
NinQ61043 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30,27■■■□□ 2,44
NinQ61043 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC30,26■■■□□ 2,43
NinQ61043 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
NinQ61043 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30,25■■■□□ 2,43
NinQ61043 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,24■■■□□ 2,43
NinQ61043 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
NinQ61043 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
NinQ61043 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
NinQ61043 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
NinQ61043 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,22■■■□□ 2,43
NinQ61043 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
NinQ61043 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
NinQ61043 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
NinQ61043 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
NinQ61043 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
NinQ61043 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30,19■■■□□ 2,42
NinQ61043 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,19■■■□□ 2,42
NinQ61043 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC30,18■■■□□ 2,42
NinQ61043 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
NinQ61043 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
NinQ61043 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
NinQ61043 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
NinQ61043 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
NinQ61043 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
NinQ61043 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30,16■■■□□ 2,42
NinQ61043 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,4 ms