Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Laptm4aQ60961 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Laptm4aQ60961 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Laptm4aQ60961 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Laptm4aQ60961 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Laptm4aQ60961 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Laptm4aQ60961 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Laptm4aQ60961 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Laptm4aQ60961 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Laptm4aQ60961 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Laptm4aQ60961 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Laptm4aQ60961 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Laptm4aQ60961 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Laptm4aQ60961 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Laptm4aQ60961 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Laptm4aQ60961 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Laptm4aQ60961 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Laptm4aQ60961 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Laptm4aQ60961 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Laptm4aQ60961 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Laptm4aQ60961 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Laptm4aQ60961 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Laptm4aQ60961 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Laptm4aQ60961 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Laptm4aQ60961 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Laptm4aQ60961 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Laptm4aQ60961 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Laptm4aQ60961 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Laptm4aQ60961 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Laptm4aQ60961 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Laptm4aQ60961 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Laptm4aQ60961 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Laptm4aQ60961 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Laptm4aQ60961 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Laptm4aQ60961 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Laptm4aQ60961 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Laptm4aQ60961 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Laptm4aQ60961 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Laptm4aQ60961 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Laptm4aQ60961 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Laptm4aQ60961 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Laptm4aQ60961 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Laptm4aQ60961 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Laptm4aQ60961 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Laptm4aQ60961 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Laptm4aQ60961 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Laptm4aQ60961 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Laptm4aQ60961 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Laptm4aQ60961 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Laptm4aQ60961 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Laptm4aQ60961 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Laptm4aQ60961 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Laptm4aQ60961 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Laptm4aQ60961 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Laptm4aQ60961 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Laptm4aQ60961 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Laptm4aQ60961 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Laptm4aQ60961 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Laptm4aQ60961 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Laptm4aQ60961 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Laptm4aQ60961 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Laptm4aQ60961 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Laptm4aQ60961 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Laptm4aQ60961 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Laptm4aQ60961 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Laptm4aQ60961 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Laptm4aQ60961 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Laptm4aQ60961 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Laptm4aQ60961 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Laptm4aQ60961 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Laptm4aQ60961 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Laptm4aQ60961 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Laptm4aQ60961 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Laptm4aQ60961 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Laptm4aQ60961 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Laptm4aQ60961 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Laptm4aQ60961 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Laptm4aQ60961 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Laptm4aQ60961 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Laptm4aQ60961 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Laptm4aQ60961 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Laptm4aQ60961 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Laptm4aQ60961 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Laptm4aQ60961 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Laptm4aQ60961 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Laptm4aQ60961 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Laptm4aQ60961 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Laptm4aQ60961 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Laptm4aQ60961 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Laptm4aQ60961 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Laptm4aQ60961 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Laptm4aQ60961 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Laptm4aQ60961 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Laptm4aQ60961 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Laptm4aQ60961 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Laptm4aQ60961 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Laptm4aQ60961 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Laptm4aQ60961 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Laptm4aQ60961 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Laptm4aQ60961 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms