Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vdac1Q60932 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vdac1Q60932 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vdac1Q60932 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Vdac1Q60932 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Vdac1Q60932 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vdac1Q60932 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Vdac1Q60932 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vdac1Q60932 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vdac1Q60932 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Vdac1Q60932 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vdac1Q60932 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vdac1Q60932 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vdac1Q60932 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vdac1Q60932 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vdac1Q60932 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vdac1Q60932 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vdac1Q60932 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vdac1Q60932 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vdac1Q60932 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vdac1Q60932 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vdac1Q60932 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Vdac1Q60932 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vdac1Q60932 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vdac1Q60932 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vdac1Q60932 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vdac1Q60932 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vdac1Q60932 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vdac1Q60932 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vdac1Q60932 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vdac1Q60932 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vdac1Q60932 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vdac1Q60932 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vdac1Q60932 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vdac1Q60932 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vdac1Q60932 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vdac1Q60932 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vdac1Q60932 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vdac1Q60932 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vdac1Q60932 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vdac1Q60932 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vdac1Q60932 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vdac1Q60932 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vdac1Q60932 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vdac1Q60932 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vdac1Q60932 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vdac1Q60932 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vdac1Q60932 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vdac1Q60932 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vdac1Q60932 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vdac1Q60932 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vdac1Q60932 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vdac1Q60932 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vdac1Q60932 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vdac1Q60932 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vdac1Q60932 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vdac1Q60932 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vdac1Q60932 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vdac1Q60932 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vdac1Q60932 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vdac1Q60932 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vdac1Q60932 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vdac1Q60932 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vdac1Q60932 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vdac1Q60932 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vdac1Q60932 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vdac1Q60932 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vdac1Q60932 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vdac1Q60932 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vdac1Q60932 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vdac1Q60932 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vdac1Q60932 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vdac1Q60932 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vdac1Q60932 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vdac1Q60932 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vdac1Q60932 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vdac1Q60932 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vdac1Q60932 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vdac1Q60932 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vdac1Q60932 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vdac1Q60932 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vdac1Q60932 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vdac1Q60932 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vdac1Q60932 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vdac1Q60932 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vdac1Q60932 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vdac1Q60932 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vdac1Q60932 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vdac1Q60932 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vdac1Q60932 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vdac1Q60932 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vdac1Q60932 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vdac1Q60932 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vdac1Q60932 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vdac1Q60932 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vdac1Q60932 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vdac1Q60932 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vdac1Q60932 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vdac1Q60932 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vdac1Q60932 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms