Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Sik1Q60670 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Sik1Q60670 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Sik1Q60670 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Sik1Q60670 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Sik1Q60670 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Sik1Q60670 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC33,69■■■□□ 2,98
Sik1Q60670 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Sik1Q60670 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
Sik1Q60670 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,66■■■□□ 2,98
Sik1Q60670 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Sik1Q60670 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC33,64■■■□□ 2,98
Sik1Q60670 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,64■■■□□ 2,98
Sik1Q60670 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC33,62■■■□□ 2,97
Sik1Q60670 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Sik1Q60670 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33,61■■■□□ 2,97
Sik1Q60670 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Sik1Q60670 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Sik1Q60670 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Sik1Q60670 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Sik1Q60670 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,53■■■□□ 2,96
Sik1Q60670 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,52■■■□□ 2,96
Sik1Q60670 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,52■■■□□ 2,96
Sik1Q60670 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC33,5■■■□□ 2,95
Sik1Q60670 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Sik1Q60670 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Sik1Q60670 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33,48■■■□□ 2,95
Sik1Q60670 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Sik1Q60670 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,45■■■□□ 2,95
Sik1Q60670 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Sik1Q60670 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33,41■■■□□ 2,94
Sik1Q60670 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33,41■■■□□ 2,94
Sik1Q60670 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33,37■■■□□ 2,93
Sik1Q60670 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Sik1Q60670 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC33,36■■■□□ 2,93
Sik1Q60670 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Sik1Q60670 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Sik1Q60670 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Sik1Q60670 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC33,34■■■□□ 2,93
Sik1Q60670 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Sik1Q60670 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,33■■■□□ 2,93
Sik1Q60670 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC33,32■■■□□ 2,92
Sik1Q60670 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Sik1Q60670 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Sik1Q60670 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Sik1Q60670 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,3■■■□□ 2,92
Sik1Q60670 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC33,3■■■□□ 2,92
Sik1Q60670 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC33,28■■■□□ 2,92
Sik1Q60670 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,27■■■□□ 2,92
Sik1Q60670 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33,27■■■□□ 2,92
Sik1Q60670 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,91
Sik1Q60670 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Sik1Q60670 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33,24■■■□□ 2,91
Sik1Q60670 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33,23■■■□□ 2,91
Sik1Q60670 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC33,22■■■□□ 2,91
Sik1Q60670 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Sik1Q60670 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Sik1Q60670 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Sik1Q60670 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,18■■■□□ 2,9
Sik1Q60670 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Sik1Q60670 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33,18■■■□□ 2,9
Sik1Q60670 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Sik1Q60670 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Sik1Q60670 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Sik1Q60670 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Sik1Q60670 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Sik1Q60670 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Sik1Q60670 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Sik1Q60670 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Sik1Q60670 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Sik1Q60670 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC33,12■■■□□ 2,89
Sik1Q60670 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33,1■■■□□ 2,89
Sik1Q60670 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Sik1Q60670 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33,07■■■□□ 2,88
Sik1Q60670 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Sik1Q60670 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Sik1Q60670 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Sik1Q60670 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Sik1Q60670 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33,03■■■□□ 2,88
Sik1Q60670 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33,03■■■□□ 2,88
Sik1Q60670 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Sik1Q60670 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Sik1Q60670 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,01■■■□□ 2,87
Sik1Q60670 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,87
Sik1Q60670 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Sik1Q60670 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33■■■□□ 2,87
Sik1Q60670 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Sik1Q60670 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Sik1Q60670 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Sik1Q60670 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,99■■■□□ 2,87
Sik1Q60670 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Sik1Q60670 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC32,98■■■□□ 2,87
Sik1Q60670 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Sik1Q60670 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Sik1Q60670 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Sik1Q60670 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Sik1Q60670 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32,94■■■□□ 2,86
Sik1Q60670 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Sik1Q60670 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Sik1Q60670 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC32,92■■■□□ 2,86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,2 ms