Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Myh1Q5SX40 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Myh1Q5SX40 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Myh1Q5SX40 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Myh1Q5SX40 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Myh1Q5SX40 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Myh1Q5SX40 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Myh1Q5SX40 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Myh1Q5SX40 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Myh1Q5SX40 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Myh1Q5SX40 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Myh1Q5SX40 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Myh1Q5SX40 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Myh1Q5SX40 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Myh1Q5SX40 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Myh1Q5SX40 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Myh1Q5SX40 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Myh1Q5SX40 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Myh1Q5SX40 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Myh1Q5SX40 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Myh1Q5SX40 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Myh1Q5SX40 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Myh1Q5SX40 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Myh1Q5SX40 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Myh1Q5SX40 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Myh1Q5SX40 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Myh1Q5SX40 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Myh1Q5SX40 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Myh1Q5SX40 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Myh1Q5SX40 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Myh1Q5SX40 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Myh1Q5SX40 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Myh1Q5SX40 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Myh1Q5SX40 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Myh1Q5SX40 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Myh1Q5SX40 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Myh1Q5SX40 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Myh1Q5SX40 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Myh1Q5SX40 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Myh1Q5SX40 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Myh1Q5SX40 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Myh1Q5SX40 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Myh1Q5SX40 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Myh1Q5SX40 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Myh1Q5SX40 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Myh1Q5SX40 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Myh1Q5SX40 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Myh1Q5SX40 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Myh1Q5SX40 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Myh1Q5SX40 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Myh1Q5SX40 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Myh1Q5SX40 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Myh1Q5SX40 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Myh1Q5SX40 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Myh1Q5SX40 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Myh1Q5SX40 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Myh1Q5SX40 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Myh1Q5SX40 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Myh1Q5SX40 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Myh1Q5SX40 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Myh1Q5SX40 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Myh1Q5SX40 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Myh1Q5SX40 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Myh1Q5SX40 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Myh1Q5SX40 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Myh1Q5SX40 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Myh1Q5SX40 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Myh1Q5SX40 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Myh1Q5SX40 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Myh1Q5SX40 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Myh1Q5SX40 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Myh1Q5SX40 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Myh1Q5SX40 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Myh1Q5SX40 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Myh1Q5SX40 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Myh1Q5SX40 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Myh1Q5SX40 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Myh1Q5SX40 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Myh1Q5SX40 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Myh1Q5SX40 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Myh1Q5SX40 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Myh1Q5SX40 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Myh1Q5SX40 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Myh1Q5SX40 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
Myh1Q5SX40 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Myh1Q5SX40 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Myh1Q5SX40 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Myh1Q5SX40 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Myh1Q5SX40 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Myh1Q5SX40 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Myh1Q5SX40 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Myh1Q5SX40 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Myh1Q5SX40 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Myh1Q5SX40 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Myh1Q5SX40 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Myh1Q5SX40 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Myh1Q5SX40 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Myh1Q5SX40 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Myh1Q5SX40 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Myh1Q5SX40 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms